R语言dyngen包说明文档（版本 0.4.0）

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backbone 仿真模型的主干
backbone_bifurcating 所有预定义主干模型的列表
backbone_bifurcating_converging 所有预定义主干模型的列表
backbone_bifurcating_cycle 所有预定义主干模型的列表
backbone_bifurcating_loop 所有预定义主干模型的列表
backbone_binary_tree 所有预定义主干模型的列表
backbone_branching 所有预定义主干模型的列表
backbone_consecutive_bifurcating 所有预定义主干模型的列表
backbone_converging 所有预定义主干模型的列表
backbone_cycle 所有预定义主干模型的列表
backbone_cycle_simple 所有预定义主干模型的列表
backbone_disconnected 所有预定义主干模型的列表
backbone_linear 所有预定义主干模型的列表
backbone_linear_simple 所有预定义主干模型的列表
backbone_trifurcating 所有预定义主干模型的列表
bblego 轻松设计您自己的定制主干
bblego_branching 轻松设计您自己的定制主干
bblego_end 轻松设计您自己的定制主干
bblego_linear 轻松设计您自己的定制主干
bblego_start 轻松设计您自己的定制主干
dyngen dyngen：一个用于单细胞组学分析的多模式模拟器
example_model A（非常！）小玩具dyngen模型
experiment_snapshot 模拟中的样本单元
experiment_synchronised 模拟中的样本单元
feature_network_default 生成目标网络
generate_cells 模拟细胞
generate_dataset 生成数据集
generate_experiment 模拟中的样本单元
generate_feature_network 生成目标网络
generate_gold_standard 模拟金本位制
generate_kinetics 确定特征网络的动力学
generate_tf_network 从主干生成转录因子网络
gold_standard_default 模拟金本位制
initialise_model 模拟dyngen数据集的初始设置
kinetics_default 确定特征网络的动力学
kinetics_noise_none 为每个模拟的动力学添加小噪声
kinetics_noise_simple 为每个模拟的动力学添加小噪声
list_backbones 所有预定义主干模型的列表
list_experiment_samplers 模拟中的样本单元
plot_backbone_modulenet 可视化模型的主干
plot_backbone_statenet 可视化模型的主干状态网络
plot_feature_network 可视化模型的特征网络
plot_gold_expression 在模拟时间内可视化金标准的表达
plot_gold_mappings 可视化模拟到金标准的映射
plot_gold_simulations 使用dimred可视化模拟
plot_simulations 使用dimred可视化模拟
plot_simulation_expression 在模拟时间内可视化模拟的表达式
realcounts 一组真正的单细胞表达数据集
realnets 一套黄金标准的基因调控网络
rnorm_bounded rnorm的有界版本
simtime_from_backbone 从主干确定模拟时间
simulation_default 模拟细胞
simulation_type_knockdown 模拟细胞
simulation_type_wild_type 模拟细胞
tf_network_default 从主干生成转录因子网络
wrap_dataset 将模拟包装到dynwrap对象中