R语言decode包说明文档(版本 1.2)

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getAssoGeneSetPValue 计算所选基因与功能基因集之间的p值
getBestAssociatedGeneSet 为基因i的划分得到最佳关联的功能基因集
getBonferroniPValue 通过Bonferroni校正调整p值
getDE_DC_OptimalThreshold 执行卡方优化
getFDR 用Benjamini法和Hochberg法调整p值
getPartitionIndex 获取基因i的8个分区的基因索引
getPathway 读取功能基因集
openFileToWrite 打开文件写入结果
runDecode 差异共表达与差异表达分析
sumResult_MinGain 将功能基因集结果汇总到文本文件中