getAssoGeneSetPValue | 计算所选基因与功能基因集之间的p值 | ||
getBestAssociatedGeneSet | 为基因i的划分得到最佳关联的功能基因集 | ||
getBonferroniPValue | 通过Bonferroni校正调整p值 | ||
getDE_DC_OptimalThreshold | 执行卡方优化 | ||
getFDR | 用Benjamini法和Hochberg法调整p值 | ||
getPartitionIndex | 获取基因i的8个分区的基因索引 | ||
getPathway | 读取功能基因集 | ||
openFileToWrite | 打开文件写入结果 | ||
runDecode | 差异共表达与差异表达分析 | ||
sumResult_MinGain | 将功能基因集结果汇总到文本文件中 |