debar-package | “除名” | ||
aa_check | 翻译序列和它的终止密码子 | ||
aa_check.DNAseq | 翻译序列和它的终止密码子 | ||
adjust | 根据nt路径输出调整序列。 | ||
adjust.DNAseq | 根据nt路径输出调整序列。 | ||
censored_translation | DNA串的删减翻译。 | ||
consensus | 取去噪后的序列列表,得到一致序列。 | ||
consensus_sequence | 取去噪后的序列列表,得到一致序列。 | ||
debar | “除名” | ||
denoise | 运行去噪器管道进行序列读取。 | ||
denoise.default | 运行去噪器管道进行序列读取。 | ||
denoise_file | 对给定文件中的序列数据进行去噪。 | ||
denoise_file.default | 对给定文件中的序列数据进行去噪。 | ||
denoise_list | COI条形码序列的列表到列表去噪。 | ||
dir_check | 取一个输入序列,将正向和反向恭维词与PHMM对齐 | ||
DNAseq | 从DNA序列字符串构建DNAseq对象。 | ||
example_nt_string | 示例coi5p DNA序列字符串。 | ||
example_nt_string_errors | 带有插入和删除错误的coi5p DNA序列字符串示例。 | ||
ex_nt_list | 四个coi5p序列的列表示例,每个序列都包含indel错误。 | ||
frame | 取一个DNAseq对象并隔离COI-5P区域。 | ||
frame.DNAseq | 取一个DNAseq对象并隔离COI-5P区域。 | ||
outseq | 获取读取的最终去噪输出序列。 | ||
outseq.DNAseq | 获取读取的最终去噪输出序列。 | ||
read_fasta | 从fasta文件读入原始数据。 | ||
read_fastq | 从fastq文件读入原始数据。 | ||
write_fasta | 将去噪后的共识序列输出到fasta文件。 | ||
write_fasta.DNAseq | 将去噪后的共识序列输出到fasta文件。 | ||
write_fastq | 将去噪后的序列输出为带有占位符短语分数的fastq格式。 | ||
write_fastq.DNAseq | 将去噪后的序列输出为带有占位符短语分数的fastq格式。 |