R语言cooccur包说明文档(版本 1.3)

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cooccur-package cooccur:R中物种共现的概率分析
beetles 甲虫发生数据来自(Ulrich和Zalewski 2006)。
cooccur 从社区数据集中计算成对共现模式的函数
create.N.matrix 函数从潜在的spp x位点矩阵创建潜在共现位点(N)的spp x spp矩阵。
effect.sizes 函数从类“cooccur”的对象中提取物种成对效应大小。
finches 芬奇发生数据来自(Sanderson 2000)。
obs.v.exp 函数用于绘制从存储在“cocurr”对象中的分析中观察到的oc出现与预期oc出现的可视化效果。
pair 用于检查单个物种的共现模式的函数。
pair.attributes 函数创建一个物种共现模式的总结。
pair.profile 函数生成物种对共现模式的贡献的可视化。
plot.cooccur 用于生成热图共生可视化的函数。
print.cooccur 打印重要的成对物种结果。
prob.table 函数从物种共现分析中提取概率表。
rodents 啮齿动物发生数据来自(Brown和Kurzius 1987)。
summary.cooccur 方法总结共现模式。