R语言coalescentMCMC包说明文档(版本 0.4-1)

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cleanMCMCtrees 对合并树运行MCMC
coalescentMCMC 对合并树运行MCMC
dcoal 各种含时聚结模型的密度函数
dcoal.linear 各种含时聚结模型的密度函数
dcoal.step 各种含时聚结模型的密度函数
dcoal.time 各种含时聚结模型的密度函数
dcoal.time2 各种含时聚结模型的密度函数
EdgeLengthJittering 运行MCMC的树运算符
getLastTree 对合并树运行MCMC
getMCMCstats 对合并树运行MCMC
getMCMCtrees 对合并树运行MCMC
NeighborhoodRearrangement 运行MCMC的树运算符
saveMCMCtrees 对合并树运行MCMC
sim.coalescent 聚结模拟与可视化
TipInterchange 运行MCMC的树运算符
treeOperators 运行MCMC的树运算符