clinDR-package | 临床剂量反应的贝叶斯和最大似然Emax模型拟合、图形和模拟。 | ||
"Extract.emaxsim" | 从emaxsim的输出中提取模拟 | ||
"Extract.emaxsimB" | 从emaxsimB的输出中提取模拟 | ||
checkMonoEmax | Emax(单调)模型拟合的Bayes后验预测检验 | ||
coef.emaxsim | 提取Emax模型参数估计 | ||
coef.emaxsimB | 提取Emax模型参数估计 | ||
coef.fitEmax | 提取Emax模型参数估计 | ||
coef.fitEmaxB | 提取Emax模型参数估计 | ||
compileStanModels | 安装包“clinDR”后编译“rstan”Emax模型 | ||
DRDensityPlot | 绘制点网格上的贝叶斯或置信区间密度等值线(通常是剂量或时间) | ||
emaxalt | 拟合4参数或3参数Emax模型,如果无法收敛,则用更简单的曲线代替。 | ||
emaxfun | 双曲和S形Emax模型的矢量化版本 | ||
emaxPrior.control | 为“fitEmaxB”中实现的Emax模型设置先验分布的参数。 | ||
emaxsim | 模拟Emax极大似然估计 | ||
emaxsimB | 模拟Emax贝叶斯估计 | ||
fitEmax | 双曲线或sigmoidal Emax模型对连续/二元剂量反应数据的ML拟合。 | ||
fitEmaxB | 双曲线或sigmoidal Emax模型对连续/二元剂量反应数据的贝叶斯拟合。 | ||
FixedMean | 固定平均数(比例)随机数据构造函数,用于连续或二进制数据的emaxsim | ||
mcmc.control | 函数“fitEmaxB”中“restan”执行的设置 | ||
metaData | 多个已发表荟萃分析的剂量反应数据 | ||
nllogis | 二元剂量反应logit标度上3或4参数Emax模型的负对数似然函数。 | ||
plot.emaxsim | 绘制emaxsim的输出 | ||
plot.emaxsimB | 绘制emaxsimB的输出 | ||
plot.emaxsimBobj | 从emaxsimB生成的数据集绘制剂量响应图 | ||
plot.emaxsimobj | 从emaxsim生成的数据集绘制剂量响应图 | ||
plot.fitEmax | 绘制Emax模型和剂量组平均值。 | ||
plot.fitEmaxB | 绘制Emax模型和剂量组平均值。 | ||
plot.plotB | 绘制Bayes剂量反应曲线和剂量组平均值 | ||
plotB | 绘制Bayes剂量反应曲线和剂量组平均值 | ||
plotBdensity | 显示Bayes前后剂量反应的密度图 | ||
plotD | 剂量组基本图 | ||
predict.emaxalt | 通过函数emaxalt输出的模拟对象指定剂量的平均响应和SE | ||
predict.emaxsim | emaxsim对象中每个复制数据集的指定剂量的平均响应和SE | ||
predict.emaxsimB | emaxsimB对象中每个复制数据集的平均响应和SE | ||
predict.emaxsimBobj | 模拟emaxsimBobj对象指定剂量的平均反应估计(后验平均数)和SE(后验标准差) | ||
predict.emaxsimobj | 模拟EmaxiMobj对象指定剂量的平均反应和SE | ||
predict.fitEmax | 由3或4参数Emax模型的最大似然拟合得出的估计均值/比例和置信区间。 | ||
predict.fitEmaxB | 从贝叶斯双曲线或sigmiodial Emax模型得出的估计平均值和后验间隔。 | ||
print.emaxsim | 从emaxsim打印模拟输出 | ||
print.emaxsimB | 从emaxsimB打印模拟输出 | ||
print.emaxsimBobj | 打印已安装的Emax型号的摘要 | ||
print.emaxsimobj | 打印由emaxsim生成的数据集 | ||
print.fitEmax | 打印已安装的Emax型号的摘要 | ||
print.fitEmaxB | 打印拟合的贝叶斯Emax模型的摘要 | ||
prior.control | 为“fitEmaxB”中实现的Emax模型设置先验分布的参数。 | ||
RandEmax | emaxsim的随机数据构造函数为连续或二进制数据的Emax模型创建随机参数。 | ||
SeEmax | 三参数或四参数Emax模型剂量反应估计的渐近SE | ||
selEstan | 选择预编译的“rstan”Emax模型 | ||
showStanModels | 显示“STAN”型号代码。 | ||
sigma.emaxsim | 提取Emax模型残差SD估计 | ||
sigma.emaxsimB | 提取Emax模型残差SD估计 | ||
sigma.fitEmax | 提取Emax模型残差SD估计 | ||
sigma.fitEmaxB | 提取Emax模型残差SD估计 | ||
solveDose | 求解目标值的Emax函数 | ||
solveEmax | 求解目标值的Emax函数 | ||
startEmax | 计算3-Emax或4-Emax模型的起始参数值。 | ||
summary.emaxsim | emaxsim输出摘要 | ||
summary.emaxsimB | emaxsimB输出汇总 | ||
summary.emaxsimBobj | 将Emax fit汇总到emaxsimB生成的数据集 | ||
summary.emaxsimobj | 将Emax fit汇总到emaxsim生成的数据集 | ||
summary.fitEmax | 打印已安装的Emax型号的摘要 | ||
summary.fitEmaxB | 打印拟合的贝叶斯Emax模型的摘要 | ||
targetBeta | 找到与指定概率匹配的比例Beta分布 | ||
targetCI | 对于emaxsim对象中的每个模拟示例,计算置信区间超过安慰剂目标变化的剂量。 | ||
targetD | 计算从安慰剂中获得特定目标改善的剂量的MLE(及其SE)。 | ||
update.emaxsimobj | 在emaxsim生成的数据集中更新估计 | ||
vcov.emaxsim | 最大似然估计的Emax模型方差协方差矩阵的提取 | ||
vcov.fitEmax | 最大似然估计的Emax模型方差协方差矩阵的提取 | ||
[.emaxsim | 从emaxsim的输出中提取模拟 | ||
[.emaxsimB | 从emaxsimB的输出中提取模拟 |