R语言cgdsr包说明文档(版本 1.3.0)

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cgdsr-package CGDS-R:用于访问MSKCC癌症基因组数据服务器(CGDS)中数据的库。
CGDS 构造一个CGDS连接对象
cgdsr CGDS-R:用于访问MSKCC癌症基因组数据服务器(CGDS)中数据的库。
cgdsr-CGDS 构造一个CGDS连接对象
cgdsr-getCancerStudies 在CGDS中获得可用的癌症研究
cgdsr-getCaseLists 获取特定癌症研究的可用病例列表
cgdsr-getClinicalData 获取癌症研究的临床数据
cgdsr-getGeneticProfiles 获取特定癌症研究的可用基因数据
cgdsr-getMutationData 获取癌症研究的突变数据
cgdsr-getProfileData 检索基因和遗传图谱的基因组图谱数据。
cgdsr-plot CGDS API数据的通用绘图函数。
cgdsr-processURL CGDS库的内部方法。
cgdsr-setPlotErrorMsg 设置自定义绘图错误消息
cgdsr-setVerbose 为CGDS函数调用设置详细日志记录级别
cgdsr-test CGDS对象的简单测试套件。
getCancerStudies 在CGDS中获得可用的癌症研究
getCancerStudies.CGDS 在CGDS中获得可用的癌症研究
getCaseLists 获取特定癌症研究的可用病例列表
getCaseLists.CGDS 获取特定癌症研究的可用病例列表
getClinicalData 获取癌症研究的临床数据
getClinicalData.CGDS 获取癌症研究的临床数据
getGeneticProfiles 获取特定癌症研究的可用基因数据
getGeneticProfiles.CGDS 获取特定癌症研究的可用基因数据
getMutationData 获取癌症研究的突变数据
getMutationData.CGDS 获取癌症研究的突变数据
getProfileData 检索基因和遗传图谱的基因组图谱数据。
getProfileData.CGDS 检索基因和遗传图谱的基因组图谱数据。
plot CGDS API数据的通用绘图函数。
plot.CGDS CGDS API数据的通用绘图函数。
processURL CGDS库的内部方法。
processURL.CGDS CGDS库的内部方法。
setPlotErrorMsg 设置自定义绘图错误消息
setPlotErrorMsg.CGDS 设置自定义绘图错误消息
setVerbose 为CGDS函数调用设置详细日志记录级别
setVerbose.CGDS 为CGDS函数调用设置详细日志记录级别
test CGDS对象的简单测试套件。
test.CGDS CGDS对象的简单测试套件。