R语言celltrackR包说明文档(版本 0.3.1)
返回R语言所有包列表
aggregate.tracks
计算子目录的摘要统计信息
analyzeCellPairs
查找所有轨迹对的距离和角度
analyzeStepPairs
找出所有成对台阶的距离和角度
AngleAnalysis
角度分析
angleCells
两个轨道之间的角度
angleSteps
两步之间的角度
angleToDir
与参考方向的角度
angleToPlane
与基准面的夹角
angleToPoint
与参考点的角度
applyStaggered
以交错方式计算轨道上的测量值
as.data.frame.tracks
将轨迹转换为数据帧
as.list.tracks
从曲目转换为列表
as.tracks
跟踪对象
as.tracks.data.frame
从数据帧转换为轨迹
as.tracks.list
跟踪对象
asphericity
跟踪测量
BCells
双光子数据:淋巴结中的B细胞
beaucheminTrack
用Beauchemin模型模拟三维细胞轨迹
bootstrapTrack
从真实的轨迹数据集通过速度和转角的自举来模拟轨迹
boundingBox
轨迹对象的边界框
brownianTrack
模拟不相关的随机游走
c.tracks
跟踪对象
cellPairs
找到成对的轨迹
celltrackR
celltrackR:运动的定量分析。
cheatsheet
打开包装备忘单
clusterTracks
群集轨迹
displacement
跟踪测量
displacementRatio
跟踪测量
displacementVector
跟踪测量
distanceCells
两个单元格之间的最小距离
distanceSteps
两步之间的距离
distanceToPlane
到参照平面的距离
distanceToPoint
到参考点的距离
duration
跟踪测量
filterTracks
过滤轨迹
fractalDimension
跟踪测量
getFeatureMatrix
获取特征矩阵
hotellingsTest
测试运动的无偏性
hurstExponent
跟踪测量
interpolateTrack
插值轨迹位置
is.tracks
跟踪对象
maxDisplacement
跟踪测量
maxTrackLength
最长轨道长度
meanTurningAngle
跟踪测量
Neutrophils
双光子数据:感染肺中的中性粒细胞
normalizeToDuration
规范化度量以跟踪持续时间
normalizeTracks
规格化轨迹
outreachRatio
跟踪测量
overallAngle
跟踪测量
overallDot
跟踪测量
overallNormDot
跟踪测量
plot.tracks
在二维中打印轨迹
plot3d
在3D中打印轨迹
plotTrackMeasures
轨道测度的二元散点图
prefixes
获取曲目前缀
projectDimensions
提取空间维度
read.tracks.csv
从文本文件读取曲目
repairGaps
包含间隙的过程轨迹
selectSteps
从轨迹的子集获取在特定时间开始的单个步骤
selectTracks
按测量值选择轨迹
simulateTracks
通过模拟生成轨迹
sort.tracks
按时间排序轨迹位置
speed
跟踪测量
splitTrack
将轨迹分割为多个轨迹
squareDisplacement
跟踪测量
staggered
函数的交错版本
stepPairs
查找同时发生的成对步骤
straightness
跟踪测量
subsample
按常数因子的子样本轨迹
subtracks
将轨迹分解为子轨迹
subtracksByTime
从特定时间开始提取子轨迹
TCells
双光子数据:淋巴结中的T细胞
timePoints
在轨迹数据集中查找所有唯一的时间点
timeStep
计算轨迹的时间步长
trackFeatureMap
航迹特征的降维
trackLength
跟踪测量
TrackMeasures
跟踪测量
tracks
跟踪对象
vecAngle
两个矢量之间的角度
wrapTrack
从单个轨迹创建轨迹对象