R语言celltrackR包说明文档(版本 0.3.1)

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aggregate.tracks 计算子目录的摘要统计信息
analyzeCellPairs 查找所有轨迹对的距离和角度
analyzeStepPairs 找出所有成对台阶的距离和角度
AngleAnalysis 角度分析
angleCells 两个轨道之间的角度
angleSteps 两步之间的角度
angleToDir 与参考方向的角度
angleToPlane 与基准面的夹角
angleToPoint 与参考点的角度
applyStaggered 以交错方式计算轨道上的测量值
as.data.frame.tracks 将轨迹转换为数据帧
as.list.tracks 从曲目转换为列表
as.tracks 跟踪对象
as.tracks.data.frame 从数据帧转换为轨迹
as.tracks.list 跟踪对象
asphericity 跟踪测量
BCells 双光子数据:淋巴结中的B细胞
beaucheminTrack 用Beauchemin模型模拟三维细胞轨迹
bootstrapTrack 从真实的轨迹数据集通过速度和转角的自举来模拟轨迹
boundingBox 轨迹对象的边界框
brownianTrack 模拟不相关的随机游走
c.tracks 跟踪对象
cellPairs 找到成对的轨迹
celltrackR celltrackR:运动的定量分析。
cheatsheet 打开包装备忘单
clusterTracks 群集轨迹
displacement 跟踪测量
displacementRatio 跟踪测量
displacementVector 跟踪测量
distanceCells 两个单元格之间的最小距离
distanceSteps 两步之间的距离
distanceToPlane 到参照平面的距离
distanceToPoint 到参考点的距离
duration 跟踪测量
filterTracks 过滤轨迹
fractalDimension 跟踪测量
getFeatureMatrix 获取特征矩阵
hotellingsTest 测试运动的无偏性
hurstExponent 跟踪测量
interpolateTrack 插值轨迹位置
is.tracks 跟踪对象
maxDisplacement 跟踪测量
maxTrackLength 最长轨道长度
meanTurningAngle 跟踪测量
Neutrophils 双光子数据:感染肺中的中性粒细胞
normalizeToDuration 规范化度量以跟踪持续时间
normalizeTracks 规格化轨迹
outreachRatio 跟踪测量
overallAngle 跟踪测量
overallDot 跟踪测量
overallNormDot 跟踪测量
plot.tracks 在二维中打印轨迹
plot3d 在3D中打印轨迹
plotTrackMeasures 轨道测度的二元散点图
prefixes 获取曲目前缀
projectDimensions 提取空间维度
read.tracks.csv 从文本文件读取曲目
repairGaps 包含间隙的过程轨迹
selectSteps 从轨迹的子集获取在特定时间开始的单个步骤
selectTracks 按测量值选择轨迹
simulateTracks 通过模拟生成轨迹
sort.tracks 按时间排序轨迹位置
speed 跟踪测量
splitTrack 将轨迹分割为多个轨迹
squareDisplacement 跟踪测量
staggered 函数的交错版本
stepPairs 查找同时发生的成对步骤
straightness 跟踪测量
subsample 按常数因子的子样本轨迹
subtracks 将轨迹分解为子轨迹
subtracksByTime 从特定时间开始提取子轨迹
TCells 双光子数据:淋巴结中的T细胞
timePoints 在轨迹数据集中查找所有唯一的时间点
timeStep 计算轨迹的时间步长
trackFeatureMap 航迹特征的降维
trackLength 跟踪测量
TrackMeasures 跟踪测量
tracks 跟踪对象
vecAngle 两个矢量之间的角度
wrapTrack 从单个轨迹创建轨迹对象