R语言cati包说明文档(版本 0.99.3)

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.Random.seed 雀形数据
AbToInd 内部功能。将丰富数据矩阵转化为类个体矩阵。
as.listofindex 转换索引将生成索引列表
barPartvar 跨嵌套尺度的方差分解
barplot.decompCTRE 多性状方差划分
barplot.Tstats 计算观察到的T统计量(T代表性状)和零期望。
ComIndex 计算度量来测试和量化社区的非随机组合
ComIndexMulti 计算多轨道度量来测试和量化社区的非随机集合
CVNND 最近邻近距离的变异系数、平均值、最小值和标准差。
decompCTRE 多性状方差划分
finch.ind 雀形数据
Fred 功能丰富度、均匀度和发散度遵循Villeger et al.2008
funky.col 辅助功能
ind.plot.finch 雀形数据
IndexByGroups 将指标应用于组。
MinMaxMST 最小生成树中最短距离与最长距离之比
MinNND 最近邻近距离的变异系数、平均值、最小值和标准差。
MND 最近邻近距离的变异系数、平均值、最小值和标准差。
MNND 最近邻近距离的变异系数、平均值、最小值和标准差。
partvar 跨嵌套尺度的方差分解
piePartvar 跨嵌套尺度的方差分解
plot.ComIndex 计算度量来测试和量化社区的非随机组合
plot.ComIndexMulti 计算多轨道度量来测试和量化社区的非随机集合
plot.listofindex 绘图社区集合索引
plot.traitflex 解压中给定性状的方差分解
plot.Tstats 计算观察到的T统计量(T代表性状)和零期望。
plotCorTstats 绘制T统计量之间的二元关系
plotDistri 用绘图函数表示性状值的密度
plotRandtest 观察指标值与零分布的对应图
plotSESvar 根据变量绘制SES值
plotSpPop 根据物种值绘制种群值
plotSpVar 根据物种值绘制种群值
print.ComIndex 计算度量来测试和量化社区的非随机组合
print.ComIndexMulti 计算多轨道度量来测试和量化社区的非随机集合
print.traitflex 解压中给定性状的方差分解
print.Tstats 计算观察到的T统计量(T代表性状)和零期望。
Pval 类Tstats、ComIndex、ComIndexMulti和listofindex的对象的p值的计算
RandCom 模拟内部和/或外部过滤的玩具模型
RaoRel 分类、功能和系统发育多样性的α、γ和β成分
samplingSubsetData 数据的抽样子集。
SDND 最近邻近距离的变异系数、平均值、最小值和标准差。
SDNND 最近邻近距离的变异系数、平均值、最小值和标准差。
ses 统计矩阵的标准化效应大小和置信区间
ses.listofindex 索引列表的标准化效果大小。
ses.Tstats 计算观察到的T统计量(T代表性状)和零期望。
sp.finch 雀形数据
SumBL 分类树状图的分支长度总和(Petchey和Gaston,2002)
summary.ComIndex 计算度量来测试和量化社区的非随机组合
summary.ComIndexMulti 计算多轨道度量来测试和量化社区的非随机集合
summary.Tstats 计算观察到的T统计量(T代表性状)和零期望。
sum_Tstats 计算观察到的T统计量(T代表性状)和零期望。
traitflex.anova 解压中给定性状的方差分解
traits.finch 雀形数据
Tstats 计算观察到的T统计量(T代表性状)和零期望。