| cancerGI-package | 癌症遗传相互作用的统计分析 | ||
| cancerGI | 癌症遗传相互作用的统计分析 | ||
| computeSmallWorldness | 计算图的小世界性 | ||
| computeSurvivalPValueForGenePairSet.output | 成对基因的生存分析 | ||
| computeSurvivalPValueGenePairAll.output | 成对基因的存活分析（与匹配个体） | ||
| computeSurvivalPValueOneGenePair | 一对基因的存活分析 | ||
| computeSurvivalPValueOneGenePair.output | 将生存分析结果写入一对基因的输出 | ||
| constructDesignMatrix | 从原始RNAi数据生成设计矩阵。 | ||
| mutations | 患者的基因突变数据。 | ||
| processDataMutSurv | 在突变和存活数据中找到匹配的个体 | ||
| RNAi | RNAi筛选中单基因敲除和双基因敲除的分子表型 | ||
| survival | 患者生存数据。 | ||
| tested_pairs | 双基因敲除试验中检测的基因对。 | ||
| testMutationalPatternAll.wrapper | 计算所有成对基因突变模式的p值和q值 |