R语言bipartite包说明文档(版本 2.15)

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bipartite-package 二部生态网分析
addEmptyColToMatrix 绘图模块Web
addEmptyRowToMatrix 绘图模块Web
array2linkmx 将webarray重塑为web X链接矩阵
as.one.mode 网络矩阵的变换
as.tnet 确保网络符合tnet标准
barrett1987 在加拿大北部的授粉网中捕获的个体。
BC 归一化度、介数和贴近度中心性
betalinkr 计算网络相异度(beta分集)及其分量
betalinkr_multi 计算网络相异度(beta分集)及其分量
betweenness_w 加权网络的介数中心性
bezerra2009 在巴西大草原的采油蜜蜂花访视网络中观察到的个体。
bipartite 二部生态网分析
C.score 计算矩阵中棋盘组合(C分数)的(标准化)平均数
CC 归一化度、介数和贴近度中心性
closeness_w 加权网络的贴近中心性
clustering_tm 双模网络聚类系数的重新定义
compart 检测隔室
computeModules 计算模块
confint 一些分析的例子
convert2moduleWeb 函数filename_edges_strength和filename_points_covered_by_landmarks
czvalues 计算网络模块的c和z
decimalr2dtable 为非负十进制值生成具有相同边际总计的矩阵
degreedistr 将函数拟合到网络中两个营养水平的累积度分布。
dfun 计算二部网络中较低营养水平的每个物种的标准化专业化指数d'(d prime)。
DIRT_LPA_wb_plus 函数filename_edges_strength和filename_points_covered_by_landmarks
discrepancy 计算矩阵的差异
distance_w 加权网络中的距离
drawModules 绘图模块Web
elberling1999 北极高山瑞典授粉网访问次数
empty 从矩阵中删除空行和空列。
endpoint 计算二部网络的端点度
extinction 模拟物种从二部网络中灭绝
fc 计算web行的函数互补性
fd 计算web行的函数互补性
frame2webs 将观测表转换为网络矩阵
genweb 生成一个随机的二部网络
getModuleCoordinates 绘图模块Web
grouplevel 在网络的两个层次(组)的每个层次上分析二部网
H2fun 二部网的专门化。
inouye1988 来自澳大利亚新南威尔士州雪山的授粉网络
intasymm 一些分析的例子
intereven 一些分析的例子
isCorrectModuleWebObject 绘图模块Web
junker2013 花卉参观网
kato1990 日本山毛榉林授粉网中捕获的个体数
kevan1970 加拿大埃尔斯米尔岛北部的授粉网络
linklevel 二部网络的链路级指标
listModuleInformation 列表模块信息
LPA_wb_plus 函数filename_edges_strength和filename_points_covered_by_landmarks
memmott1999 英国布里斯托尔附近草地上的花卉参观网
metaComputeModules 计算模块
mgen 根据给定的概率矩阵生成模拟网络
mlik 一些分析的例子
module2constraints 将矩阵的嵌套性计算为WNODA(以及NODF和WNODF)
moduleWeb-class “moduleWeb”类
mosquin1967 加拿大西北地区梅尔维尔岛的花卉参观网络
motten1982 来自美国北卡罗来纳州的春季花卉参观网络
ND 归一化度、介数和贴近度中心性
nest.smdm 将矩阵的嵌套性计算为WNODA(以及NODF和WNODF)
nested 计算嵌套性的任何一种度量
nestedcontribution 计算每种对嵌套性的贡献(相对于空模型的z分数)
nestedness 计算存在/不存在矩阵的嵌套温度
nestedrank 计算按最大嵌套度排序的矩阵中物种的秩
netstats 一些分析的例子
networklevel 二部网的全网层次分析
nodespec 计算基于节点的专业化指数
NODF 将矩阵的嵌套性计算为WNODA(以及NODF和WNODF)
NOS 根据Strona& Veech(2015)计算节点重叠和分离
npartite 计算屏蔽单模网络的索引
null.distr 基于拟合边际分布的零模型
null.t.test 比较观察到的模式和随机网。
nullmodel 为网络分析生成空模型
olesen2002aigrettes 亚速尔群岛的花卉探访网
olesen2002flores 亚速尔群岛的另一个花卉探访网
olito2015 来自加拿大落基山脉的授粉网络
ollerton2003 奥利顿2003
one.grouplevel 在网络的两个层次(组)的每个层次上分析二部网
PAC 明显竞争的可能性
PDI 配对差异指数
plot.wine 加权交互嵌套估计
plotmat 一些分析的例子
plotmatrix 绘制按拓扑结构组织的矩阵
plotModuleWeb 绘图模块Web
plotPAC 函数用于绘制圆形图以可视化潜在的明显竞争(PAC)
plotweb 可视化二部互动矩阵(例如食物网)
plotweb2 可视化三方相互作用矩阵(例如三重营养食物网)
prepareWebForPlottingModules 绘图模块Web
printoutModuleInformation 打印输出模块信息
projecting_tm 将二元加权双模网络投影到加权单模网络上。
quant2bin 一些分析的例子
r2dexternal 通过考虑外部丰度生成网络分析的空模型
readModuleData 计算模块
robustness 对物种灭绝的鲁棒性
Safariland 阿根廷的授粉网
schemske1978 来自美国伊利诺伊州乌尔巴纳的花卉参观网络
second.extinct 二部网络中的二次灭绝
shuffle.web 洗牌web条目
slope.bipartite 消光斜率模拟
small1976 加拿大渥太华泥炭沼泽的花卉参观网络
sortmatr 一些分析的例子
sortmatrext 一些分析的例子
sortmatrix 按拓扑组织矩阵
sortweb 函数对二部网站进行排序
specieslevel 在物种水平上计算网络特性的各种指数
strength 根据两种定义中的任何一种计算物种强度
swap.web 为二部网络创建空模型
symmetrise_w filename_points_covered_by_landmarks
tnet_igraph 将tnet网络导出到igraph对象
togetherness 计算岛屿上物种的相同共存和共存数目
V.ratio 按照Schluter(1984)的建议计算方差比
vazarr 传粉网络。
vazcer 传粉网络。
vazllao 传粉网络。
vazmasc 传粉网络。
vazmasnc 传粉网络。
vaznull 具有约束连通性和中等约束边际总量的零模型
vaznullexternal 通过考虑外部丰度生成网络分析的空模型
vazquec 传粉网络。
vazquenc 传粉网络。
vazquez.example 一些分析的例子
versionlog 两部分版本和更改日志
visweb 绘制函数来可视化二部食物网
web2edges 将网络矩阵转换为(加权)边列表
webs2array 将两个或多个站点放入一个站点数组中
wine 加权交互嵌套估计
WNODA 将矩阵的嵌套性计算为WNODA(以及NODF和WNODF)
WNODF 将矩阵的嵌套性计算为WNODA(以及NODF和WNODF)