R语言biclustermd包说明文档(版本 0.2.2)

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biclustermd-package 具有非随机缺失值的双聚类数据
as.Biclust 将“biclustermd”对象转换为“Biclust”对象
autoplot.biclustermd 制作稀疏双聚类结果的热图
autoplot.biclustermd_sim 两个连续双聚类图的相似性度量。
autoplot.biclustermd_sse 绘制连续双聚类迭代的平方误差和。
biclustermd 具有非随机缺失值的双聚类数据
binary_vector_gen 生成一个二进制向量,除一个值外,所有值都等于零
cell_heatmap 绘制双簇细胞大小的热图。
cell_mse 为每个双集群单元创建一个包含MSE的数据帧
cluster_iteration_sum_sse 计算每次迭代的和
col.names 用于收集列名的泛型
col.names.biclustermd 获取数据矩阵列名及其对应的列群集成员身份
col_cluster_names 获取每个列群中的列名
compare_biclusters 比较两个双聚类或一对划分矩阵
fill_empties_P 随机选择一个列原型来填充一个空的列原型
fill_empties_Q 随机选择一个行原型来填充一个空行原型
format_partition 格式化分区矩阵
gather.biclustermd 收集biclustermd对象
mse_heatmap 制作一张电池的热图
partition_gen 生成一个初始的随机划分矩阵,将N个对象划分为K个子集/组。
partition_gen_by_p 用一个划分向量p创建一个划分矩阵
part_matrix_to_vector 将分块矩阵转换为向量
position_finder 求向量中第一个非零值的索引
print.biclustermd 打印biclustermd类的对象
reorder_biclust 重新排序双群集对象以生成热图
rep_biclustermd 重复双聚类以获得最小SSE解
results_heatmap 制作稀疏双聚类结果的热图
row.names.biclustermd 获取数据矩阵行名称及其对应的行集群成员身份
row_cluster_names 获取每个行簇中的行名称
runtimes 算法运行时数据
synthetic 以合成数据为例。
tune_biclustermd 调整参数网格上的双聚类数据