R语言benthos包说明文档(版本 1.3-6)

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benthos-package 海洋底栖生态系统分析
.pool 联营
abundance 丰度
abundance_ 丰度
ambi AZTI海洋生物指数(AMBI)
ambi_ AZTI海洋生物指数(AMBI)
as_accepted 转换分类单元名称以符合WORM/TWN
benthos 海洋底栖生态系统分析
bray_curtis 布雷柯蒂斯不同
eqr 生态质量比
generic_name 二项名称filename_landmarks测试有效的二项名称,filename_edges_strength提取物种所属的属,filename_points_covered_by_landmarks提取属内的物种。
genus_to_species 属种转换
get_ambi 获取补充环境敏感度组
get_iti 获得臭名昭著的营养指数
get_taxa 读取和验证分类数据
get_worms 读取并验证Taxa Waterbeheer Nederland(TWN)数据
harmonize 协调案例
has_ambi AZTI海洋生物指数(AMBI)
has_ambi_ AZTI海洋生物指数(AMBI)
has_iti 婴儿营养指数(ITI)
has_iti_ 婴儿营养指数(ITI)
hill 希尔多样性数
hill0 希尔多样性数
hill0_ 希尔多样性数
hill1 希尔多样性数
hill1_ 希尔多样性数
hill2 希尔多样性数
hill2_ 希尔多样性数
hill_ 希尔多样性数
hpie 赫伯特种间相遇概率(PIE)
hpie_ 赫伯特种间相遇概率(PIE)
hurlbert 赫伯特期望的物种数
hurlbert_ 赫伯特期望的物种数
is_accepted 转换分类单元名称以符合蠕虫
is_accepted_ 转换分类单元名称以符合蠕虫
is_azoic 偶氮样品试验
is_binomen 二项名称filename_landmarks测试有效的二项名称,filename_edges_strength提取物种所属的属,filename_points_covered_by_landmarks提取属内的物种。
is_worms 转换分类单元名称以符合蠕虫
is_worms_ 转换分类单元名称以符合蠕虫
iti 婴儿营养指数(ITI)
iti_ 婴儿营养指数(ITI)
lnn 总丰度
lnn_ 总丰度
margalef 马加里夫多样性指数
margalef_ 马加里夫多样性指数
northsea MWTL北海Bentos数据
oosterschelde Oosterschelde海洋底栖生物数据
pool 联营
read_ambi 读取并验证环境灵敏度数据
read_beqi2 读取并验证BEQI2输入文件
read_iti 读取并验证家庭营养索引文件
read_ref 读取并验证参考文件
read_taxa 读取和验证分类数据
read_twn 读取并验证Taxa Waterbeheer Nederland(TWN)数据
rygg 瑞格多样性指数
rygg_ 瑞格多样性指数
shannon 香农指数或熵
shannon_ 香农指数或熵
simpson 辛普森集中度
simpson_ 辛普森集中度
species_richness 物种丰富度
species_richness_ 物种丰富度
specific_name 二项名称filename_landmarks测试有效的二项名称,filename_edges_strength提取物种所属的属,filename_points_covered_by_landmarks提取属内的物种。
strip_sp 二项名称filename_landmarks测试有效的二项名称,filename_edges_strength提取物种所属的属,filename_points_covered_by_landmarks提取属内的物种。
strip_spaces 删除冗余空间
total_abundance 总丰度
total_abundance_ 总丰度
to_worms 转换分类单元名称以符合蠕虫
validate_ambi 读取并验证环境灵敏度数据
validate_beqi2 读取并验证BEQI2输入文件
validate_iti 读取并验证家庭营养索引文件
validate_ref 读取并验证参考文件
validate_taxa 读取和验证分类数据
validate_twn 读取并验证Taxa Waterbeheer Nederland(TWN)数据