R语言bapred包说明文档(版本 1.0)

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bapred-package 受洗包裹
autism 自闭症数据集
avedist 批之间的平均最小距离
ba 用选择法进行批量效应调整
baaddon 插件批量效果调整
bametric 批量数据(调整后)质量的不同度量
bapred 受洗包裹
batch 数据集“孤独症”的批处理变量
combatba 战斗批量效果调整
combatbaaddon 使用战斗的插件批量效果调整
corba 批效应调整前后的平均相关
diffexprm 差异表达分析性能测量(批量效应调整后)
fabatch 利用FAbatch进行批量效应调整
fabatchaddon 基于FAbatch的插件批量效应调整
kldist 批内和批间成对距离密度的Kullback-Leibler散度
meancenter 平均定心批量效果调整
meancenteraddon 平均定心的附加批量效应调整
noba 无批量效果调整
nobaaddon 无插件批量效果调整
pcplot 基于主成分分析的批次效应可视化
pvcam 主方差分量分析估计类信号引起的变异比例
qunormaddon 使用“按值记录”的附加分位数标准化(Kostka& Spang,2008)
qunormtrain “按值记录”的分位数标准化(Kostka& Spang,2008)
ratioa 利用Ratio-A进行批量效应调整
ratioaaddon Ratio-A的附加批次效应调整
ratiog 利用Ratio-G进行批量效应调整
ratiogaddon Ratio-G的附加批量效应调整
rmaaddon 使用“按值文档”的附加模块RMA规范化(Kostka& Spang,2008)
rmatrain RMA标准化与“价值文档”(Kostka& Spang,2008)
sepscore Hornung等人(2016)中描述的分离分数
skewdiv 偏度散度得分
standardize 批量效应标准化调整
standardizeaddon 标准化批量效应调整
svaba 基于SVA的批量效应调整
svabaaddon 基于冻结SVA的插件批量效应调整
X “自闭症”数据集的协变量矩阵
y 数据集“孤独症”的目标变量