| babette | babette：贝叶斯系统发育学的一个包。 | ||
| bbt_delete_temp_files | 删除must创建的所有临时文件 | ||
| bbt_run | 跑步BEAST2 | ||
| bbt_run_from_model | 跑步BEAST2 | ||
| bbt_self_test | 做一个自我测试，以验证巴贝特工作正常。 | ||
| check_beast2_pkgs | 检查a_b是否有处理其参数所需的'BEAST2'包。否则就会停止。 | ||
| create_test_bbt_run_output | 获取two或must的示例输出。 | ||
| create_test_ns_output | 创建NS测试输出 | ||
| default_params_doc | 此函数不起任何作用。它旨在继承is参数的文档。 | ||
| get_alignment_ids_from_xml | 从一个或多个“BEAST2”XML输入文件获取对齐标识。 | ||
| get_babette_path | 获取“inst/extdata”文件夹中文件的完整路径 | ||
| get_babette_paths | 获取“inst/extdata”文件夹中文件的完整路径 | ||
| parse_beast2_output | 根据“BEAST2”包的具体信息处理“BEAST2”输出 | ||
| parse_beast2_output_to_ns | 解析BEAST2 NS输出 | ||
| plot_densitree | 在一棵树上画多棵树。 | ||
| prepare_file_creation | 准备“BEAST2”创建文件的内部函数 | ||
| update_babette | 通过安装最新版本更新所有babette依赖项 |