R语言bPeaks包说明文档(版本 1.2)

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bPeaks-package bPeaks:一种从小真核生物基因组的ChIP-seq数据中检测转录因子结合位点的直观调峰策略
baseLineCalc 函数计算基因组中每个核苷酸的平均读取次数
bPeaks bPeaks:一种从小真核生物基因组的ChIP-seq数据中检测转录因子结合位点的直观调峰策略
bPeaksAnalysis 函数来运行整个bPeaks过程
dataPDR1 用酵母中的转录因子Pdr1获得的芯片序列结果(IP和对照样品)
dataReading 函数在R中导入排序结果
dataSmoothing 平滑染色体测序覆盖的功能
peakDetection 调峰法,即用高密度的序列(读)鉴定基因组区域
peakDrawing 函数用于绘制使用bPeaks方法检测到的基因组区域的图形表示
peakLocation 根据预先定义的染色体特征定位检测到的基本峰(bpeak)的功能
yeastCDS 不同酵母CDS的注释