bPeaks-package | bPeaks:一种从小真核生物基因组的ChIP-seq数据中检测转录因子结合位点的直观调峰策略 | ||
baseLineCalc | 函数计算基因组中每个核苷酸的平均读取次数 | ||
bPeaks | bPeaks:一种从小真核生物基因组的ChIP-seq数据中检测转录因子结合位点的直观调峰策略 | ||
bPeaksAnalysis | 函数来运行整个bPeaks过程 | ||
dataPDR1 | 用酵母中的转录因子Pdr1获得的芯片序列结果(IP和对照样品) | ||
dataReading | 函数在R中导入排序结果 | ||
dataSmoothing | 平滑染色体测序覆盖的功能 | ||
peakDetection | 调峰法,即用高密度的序列(读)鉴定基因组区域 | ||
peakDrawing | 函数用于绘制使用bPeaks方法检测到的基因组区域的图形表示 | ||
peakLocation | 根据预先定义的染色体特征定位检测到的基本峰(bpeak)的功能 | ||
yeastCDS | 不同酵母CDS的注释 |