asremlPlus-package | 增加了“ASReml-R”在拟合混合模型和包时的通用性,以探索预测差异 | ||
addBacktransforms | 添加或重新计算'所有差异对象'. | ||
addBacktransforms.alldiffs | 添加或重新计算'所有差异对象'. | ||
addrm.terms.asreml | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
addrm.terms.asrtests | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
allDifferences | 使用提供的预测和成对差异的标准误差或预测的方差矩阵,形成预测集之间的所有成对差异,以及差异的p值。 | ||
allDifferences.data.frame | 使用提供的预测和成对差异的标准误差或预测的方差矩阵,形成预测集之间的所有成对差异,以及差异的p值。 | ||
alldiffs | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
alldiffs-class | alldiffs对象的描述 | ||
alldiffs.object | alldiffs对象的描述 | ||
angular | 将角度变换应用于比例。 | ||
angular.mod | 将修改的角度变换应用于计数向量。 | ||
as.alldiffs | 形成一个所有差异对象'从提供的预测,以及那些统计数据,与预测和他们的成对差异,已经提供。 | ||
as.asrtests | 形成一个asrtests对象,该对象存储(i)一个拟合的asreml对象,(ii)一个固定项的伪方差分析表,以及(iii)用于获取模型的变化历史和炒作测试。 | ||
as.predictions.frame | 形成a'预测.框架'从a'数据框,确保存在正确的列。 | ||
asremlPlus | 增加了“ASReml-R”在拟合混合模型和包时的通用性,以探索预测差异 | ||
asremlPlus-deprecated | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
asremlPlusTips | 随机呈现的启动提示。 | ||
asrtests | 形成一个asrtests对象,该对象存储(i)一个拟合的asreml对象,(ii)一个固定项的伪方差分析表,以及(iii)用于获取模型的变化历史和炒作测试。 | ||
asrtests-class | asrtests对象的描述 | ||
asrtests.object | asrtests对象的描述 | ||
bootREMLRT | 使用参数引导计算REML比率测试的p值,以比较两个模型。 | ||
bootREMLRT.asreml | 使用参数引导计算REML比率测试的p值,以比较两个模型。 | ||
changeModelOnIC | 使用信息条件决定是否更改已安装的模型。 | ||
changeModelOnIC.asrtests | 使用信息条件决定是否更改已安装的模型。 | ||
changeTerms | 从一个或两个固定或随机模型中添加和删除指定的术语集,和/或用新模型替换残差(rcov)模型。 | ||
changeTerms.asrtests | 从一个或两个固定或随机模型中添加和删除指定的术语集,和/或用新模型替换残差(rcov)模型。 | ||
ChickpeaEnd.dat | 一个大的数据集,包括在温室中进行的鹰嘴豆实验的成像数据 | ||
choose.model.asreml | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
choose.model.asrtests | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
chooseModel | 使用p值确定有效项集,并记录在数据框考虑到术语的边缘关系。 | ||
chooseModel.asrtests | 使用'asrtests.object对象,考虑到术语的等级或边缘关系。 | ||
chooseModel.data.frame | 从存储在数据框'考虑到术语的边缘关系并记录a'中使用的测试'数据框'. | ||
estimateV | 形成估计的方差、随机或残差矩阵,用于方差参数估计的观测值。 | ||
estimateV.asreml | 形成估计的方差、随机或残差矩阵,用于方差参数估计的观测值。 | ||
facCombine | 将多个因素组合成一个因素所有差异对象' | ||
facCombine.alldiffs | 将多个因素组合成一个因素所有差异对象' | ||
facRecode | 使用向量中的值重新编码因子级别。向量中的值不必是唯一的。 | ||
facRecode.alldiffs | 使用向量中的值重新编码因子级别。向量中的值不必是唯一的。 | ||
facRename | 重命名所有差异对象'. | ||
facRename.alldiffs | 重命名所有差异对象'. | ||
getASRemlVersionLoaded | 查找加载的asreml版本并返回版本中的初始字符。 | ||
getFormulae | 从asreml对象获取公式。 | ||
getFormulae.asreml | 从asreml对象获取公式。 | ||
getTestPvalue | 获取中记录的测试的p值测试摘要数据框一个人的asrtests.object对象' | ||
getTestPvalue.asrtests | 获取中记录的测试的p值测试摘要数据框一个人的asrtests.object对象' | ||
info.crit | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
info.crit.asreml | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
infoCriteria | 计算模型的AIC和BIC。 | ||
infoCriteria.asreml | 计算模型的AIC和BIC。 | ||
infoCriteria.list | 计算模型的AIC和BIC。 | ||
is.alldiffs | 测试对象是否属于alldiffs类 | ||
is.asrtests | 测试对象是否属于asrtests类 | ||
is.predictions.frame | 测试对象是否属于类预测.框架 | ||
iterate | 主题“已安装”asreml.obj公司'存储在'asrtests.object对象'以进一步迭代拟合过程。 | ||
iterate.asrtests | 主题“已安装”asreml.obj公司'存储在'asrtests.object对象'以进一步迭代拟合过程。 | ||
Ladybird.dat | 瓢虫是否转移蚜虫的实验数据 | ||
linTransform | 计算存储在'所有差异对象'. | ||
linTransform.alldiffs | 计算存储在'所有差异对象'. | ||
loadASRemlVersion | 确保加载特定版本的“asreml”。 | ||
newfit | 通过调用更新.asreml或者直接呼叫“asreml”。 | ||
newfit.asreml | 通过调用更新.asreml或者直接呼叫“asreml”。 | ||
newrcov.asrtests | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
num.recode | 使用新向量中的值重新编码向量的唯一值。 | ||
Oats.dat | 3个燕麦品种氮素响应试验资料 | ||
permute.square | 排列方阵的行和列。 | ||
permute.to.zero.lowertri | 排列一个方阵,直到所有下三角元素为零。 | ||
plotPredictions | 绘制一个术语的预测,可能带有误差线。 | ||
plotPredictions.data.frame | 绘制一个术语的预测,可能带有误差线。 | ||
plotPvalues | 绘制预测之间成对差异的p值热图。 | ||
plotPvalues.alldiffs | 绘制预测之间成对差异的p值热图。 | ||
plotPvalues.data.frame | 绘制预测之间成对差异的p值热图。 | ||
plotVariofaces | 根据Stefanova,Smith& Cullis(2009)所述,绘制经验变异函数面,包括封套。 | ||
plotvariofaces.asreml | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
plotVariofaces.data.frame | 根据Stefanova,Smith& Cullis(2009)所述,绘制经验变异函数面,包括封套。 | ||
power.transform | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
powerTransform | 对变量执行线性变换和幂变换的组合。转换后的变量存储在'数据框“数据”。 | ||
pred.present.asreml | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
predictiondiffs.asreml | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
predictionplot.asreml | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
predictions.frame | 对象的描述 | ||
predictions.frame-class | 对象的描述 | ||
predictparallel.asreml | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
predictPlus | 形成一个术语的预测,它们的成对差异和相关的统计数据。模型中可能出现具有平行值的因子,并且可以指定预测的线性变换。它产生一个alldiffs类的对象。 | ||
predictPlus.asreml | 形成一个术语的预测,它们的成对差异和相关的统计数据。模型中可能出现具有平行值的因子,并且可以指定预测的线性变换。它产生一个alldiffs类的对象。 | ||
predictPresent | 形成一个或多个术语的预测,并以表格和/或图形的形式呈现。 | ||
predictPresent.asreml | 形成一个或多个术语的预测,并以表格和/或图形的形式呈现。 | ||
print.alldiffs | 打印'所有差异对象“格式不错。 | ||
print.asrtests | 打印'asrtests.object对象' | ||
print.predictions.frame | 打印a'中的值预测.框架',有或没有标题和标题。 | ||
print.test.summary | 打印数据框包含测试摘要. | ||
print.wald.tab | 打印数据框包含Wald或pseudoanova表。 | ||
printFormulae | 从asreml对象打印公式。 | ||
printFormulae.asreml | 从asreml对象打印公式。 | ||
recalc.wald.tab.asreml | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
recalc.wald.tab.asrtests | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
recalcLSD | 添加或重新计算所有差异对象'. | ||
recalcLSD.alldiffs | 添加或重新计算所有差异对象'. | ||
recalcWaldTab | 重新计算使用'瓦尔德阿斯雷姆' | ||
recalcWaldTab.asrtests | 重新计算使用'瓦尔德阿斯雷姆' | ||
redoErrorIntervals | 添加或替换“0”的预测组件中存储的错误间隔所有差异对象'. | ||
redoErrorIntervals.alldiffs | 添加或替换“0”的预测组件中存储的错误间隔所有差异对象'. | ||
reml.lrt | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
reml.lrt.asreml | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
REMLRT | 执行REML比率测试以比较两个模型。 | ||
REMLRT.asreml | 执行REML比率测试以比较两个模型。 | ||
renewClassify | 更新所有差异对象“根据一个新的分类。 | ||
renewClassify.alldiffs | 更新所有差异对象“根据一个新的分类。 | ||
reorderClassify | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
reorderClassify.alldiffs | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
reparamSigDevn | 重新参数化每个随机(偏差)项,包括'设备fac'到一个固定的期限,并确保相同的期限,与'趋势.num'替换'设备fac'如果任何其他术语与'趋势.num'包含在'terms'中。 | ||
reparamSigDevn.asrtests | 重新参数化每个随机(偏差)项,包括'设备fac'到一个固定的期限,并确保相同的期限,与'趋势.num'替换'设备fac'如果任何其他术语与'趋势.num'包含在'terms'中。 | ||
rmboundary | 从存储在'中的拟合中删除任何边界或奇异方差分量asrtests.obj公司'并将其删除记录在'asrtests.object对象'. | ||
rmboundary.asreml | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
rmboundary.asrtests | 从存储在'中的拟合中删除任何边界或奇异方差分量asrtests.obj公司'并将其删除记录在'asrtests.object对象'. | ||
setvarianceterms | 允许为“asreml”调用的“random”和“remain”参数中的项设置边界和初始值,并对结果调用进行求值。 | ||
setvarianceterms.asreml | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
setvarianceterms.call | 允许为“asreml”调用的“random”和“remain”参数中的项设置边界和初始值,并对结果调用进行求值。 | ||
sig.devn.reparam.asreml | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
sig.devn.reparam.asrtests | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
simulate.asreml | 从多元正态分布生成模拟数据集,并保存与模拟数据相关的数量 | ||
sort.alldiffs | 对“中的组件进行排序”所有差异对象“根据与一个因素相关的预测值。 | ||
subset.alldiffs | 在一个所有差异对象“根据供应情况。 | ||
testranfix | 在使用'asreml'拟合的模型中测试单个固定或随机项,并将结果记录在'asrtests.object对象'. | ||
testranfix.asreml | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
testranfix.asrtests | 在使用'asreml'拟合的模型中测试单个固定或随机项,并将结果记录在'asrtests.object对象'. | ||
testrcov.asreml | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
testrcov.asrtests | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
testresidual | 拟合新的残差公式,测试变化是否显著,并将结果记录在asrtests.object对象'. | ||
testresidual.asrtests | 拟合新的残差公式,测试变化是否显著,并将结果记录在asrtests.object对象'. | ||
testswapran | 使用REMLRT测试当前随机模型与去掉旧项并添加新项的随机模型之间差异的显著性。结果记录在asrtests.object对象'. | ||
testswapran.asreml | asremlPlus包中已弃用的函数 | ||
testswapran.asrtests | 使用REMLRT测试当前随机模型与去掉旧项并添加新项的随机模型之间差异的显著性。结果记录在asrtests.object对象'. | ||
validAlldiffs | 检查对象是否为有效的alldiffs对象。 | ||
validAsrtests | 检查对象是否为有效的asrtests对象。 | ||
validPredictionsFrame | 检查对象是否有效预测.框架. | ||
variofaces | 绘制经验变异函数面,包括封套,如Stefanova,Smith& Cullis(2009)所述。 | ||
variofaces.asreml | 绘制经验变异函数面,包括封套,如Stefanova,Smith& Cullis(2009)所述。 | ||
WaterRunoff.dat | 径流水质随时间变化的实验数据 | ||
Wheat.dat | 1976年调查25个小麦品种的试验数据 |