R语言anovir包说明文档(版本 0.1.0)

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anovir-package anovir:毒力分析
anovir anovir:毒力分析
av_long_infected 平均寿命:受感染宿主的估计
av_long_uninfected 平均寿命:未感染宿主的估计值
check_data 检查是否正确描述了模型的数据
conf_ints_virulence 毒力的大约95%置信区间
data_blanford Blanford等人(2012)的完整数据
data_lorenz Lorenz& Koella(2011)的数据子集
data_parker Parker等人(2014)的完整数据
etd_infected 预计死亡时间:感染宿主
etd_uninfected 预期死亡时间:未感染宿主
nll_basic 负对数似然函数:基本模型
nll_basic_logscale 负对数似然函数:对数尺度上的基本模型
nll_controls 负对数似然函数:仅控制数据
nll_exposed_infected 负对数似然函数:暴露感染
nll_frailty 负对数似然函数:脆弱性
nll_frailty_correlated 负对数似然函数:相关脆弱性模型
nll_frailty_logscale 负对数似然函数:对数尺度上的脆弱变量
nll_frailty_shared 负对数似然函数:脆弱性共享
nll_proportional_virulence 负对数似然函数:nll比例毒力
nll_recovery 负对数似然函数:恢复模型
nll_recovery_II 负对数似然函数:恢复模型,无背景死亡率
nll_two_inf_subpops_obs 负对数似然函数:两个观察到的感染宿主亚群
nll_two_inf_subpops_unobs 负对数似然函数:两个未观察到的感染宿主亚群
recovery_data 模拟恢复数据
recovery_data_II 模拟恢复数据,无背景死亡率
sim_data_nll_basic 模拟two生存数据的函数