R语言analogue包说明文档(版本 0.17-5)

返回R语言所有包列表

analogue-package 古生态学的类比法和加权平均法
abernethy Abernethy森林花粉序列
analog 模拟匹配
analog.default 模拟匹配
analog.distance 模拟匹配
analogue 古生态学的类比法和加权平均法
as.data.frame.optima 加权平均最优值和公差范围
as.data.frame.tolerance 加权平均最优值和公差范围
bayesF 贝叶斯因子
Biome 北美现代花粉数据库
bootstrap Bootstrap估计及其误差
bootstrap.default Bootstrap估计及其误差
bootstrap.mat Bootstrap估计及其误差
bootstrap.wa WA模型的Bootstrap估计及其误差
bootstrapObject 引导程序对象描述
caterpillar 种的WA最优值和耐受范围的毛虫图。
caterpillarPlot 种的WA最优值和耐受范围的毛虫图。
caterpillarPlot.data.frame 种的WA最优值和耐受范围的毛虫图。
caterpillarPlot.default 种的WA最优值和耐受范围的毛虫图。
caterpillarPlot.wa 种的WA最优值和耐受范围的毛虫图。
ChiSquare 主成分回归传递函数模型
chooseTaxa 根据获得的最大丰度和出现次数选择分类群(变量)。
chooseTaxa.default 根据获得的最大丰度和出现次数选择分类群(变量)。
Climate 北美现代花粉数据库
cma 近现代类比
cma.analog 近现代类比
cma.default 近现代类比
cma.mat 近现代类比
cma.predict.mat 近现代类比
coef.pcr 主成分回归传递函数模型
coef.wa 加权平均传递函数
compare 比较两个数据集的代理
compare.default 比较两个数据集的代理
crossval 古生态传递函数模型的交叉验证
crossval.pcr 古生态传递函数模型的交叉验证
crossval.wa 古生态传递函数模型的交叉验证
densityplot 剩余长度的晶格密度图
densityplot.residLen 剩余长度的晶格密度图
deshrink WA传递函数的去收缩技术
deshrinkPred WA传递函数的去收缩技术
dissim 从模型中提取相异系数
dissimilarities 从模型中提取相异系数
dissimilarities.analog 从模型中提取相异系数
dissimilarities.mat 从模型中提取相异系数
distance 灵活计算相异度或距离度量
distance.default 灵活计算相异度或距离度量
distance.join 灵活计算相异度或距离度量
dotplot 环境和物种差异的等级相关。
dotplot.rankDC 环境和物种差异的等级相关。
eigenvals.pcr 主成分回归传递函数模型
evenSample 每个渐变段的采样数
fitted.bootstrap.mat Bootstrap估计及其误差
fitted.logitreg logistic回归模型训练集的拟合值
fitted.mat 现代模拟技术传递函数模型
fitted.pcr 主成分回归传递函数模型
fitted.prcurve 在主曲线上以99999拟合值预测新闻位置
fitted.timetrack 物种组成变化的时间轨迹
fitted.wa 加权平均传递函数
fittedY 平方剩余长度诊断
fuse 熔融相异
fuse.dist 熔融相异
fuse.matrix 熔融相异
getK 提取并设置类似物的数量
getK.bootstrap.mat 提取并设置类似物的数量
getK.default 提取并设置类似物的数量
getK.mat 提取并设置类似物的数量
getK.predict.mat 提取并设置类似物的数量
gradientDist 沿单位长度排序梯度的样本位置。
gradientDist.cca 沿单位长度排序梯度的样本位置。
gradientDist.default 沿单位长度排序梯度的样本位置。
gradientDist.prcurve 沿单位长度排序梯度的样本位置。
head.join 合并公共列上的物种数据集(物种)
Hellinger 主成分回归传递函数模型
hist.residLen 剩余长度直方图
histogram 剩余长度的格子直方图图
histogram.residLen 剩余长度的格子直方图图
ImbrieKipp Imbrie和Kipp有孔虫训练集
initCurve 将主曲线拟合到m维数据
join 合并公共列上的物种数据集(物种)
lines.prcurve 在PCA空间中绘制拟合主曲线
Location 北美现代花粉数据库
logitreg 用于评估类似物/非类似物的Logistic回归模型
logitreg.analog 用于评估类似物/非类似物的Logistic回归模型
logitreg.default 用于评估类似物/非类似物的Logistic回归模型
mat 现代模拟技术传递函数模型
mat.default 现代模拟技术传递函数模型
mat.formula 现代模拟技术传递函数模型
mcarlo 相异性的蒙特卡罗模拟
mcarlo.analog 相异性的蒙特卡罗模拟
mcarlo.default 相异性的蒙特卡罗模拟
mcarlo.mat 相异性的蒙特卡罗模拟
minDC 提取最小差异
minDC.analog 提取最小差异
minDC.default 提取最小差异
minDC.predict.mat 提取最小差异
minDC.wa 提取最小差异
n2 计算希尔N2多样性测度
n2.default 计算希尔N2多样性测度
oldDistance 灵活计算相异度或距离度量
oldDistance.default 灵活计算相异度或距离度量
oldDistance.join 灵活计算相异度或距离度量
optima 加权平均最优值和公差范围
optima.default 加权平均最优值和公差范围
panel.Loess 黄土平滑到地层图
panel.Stratiplot 地层图的面板功能
pcr 主成分回归传递函数模型
pcr.default 主成分回归传递函数模型
pcr.formula 主成分回归传递函数模型
performance 传递函数模型性能统计
performance.bootstrap.wa 传递函数模型性能统计
performance.crossval 传递函数模型性能统计
performance.pcr 主成分回归传递函数模型
performance.predict.wa 传递函数模型性能统计
performance.wa 传递函数模型性能统计
plot.bayesF 贝叶斯因子
plot.cma 近现代类比
plot.dissimilarities 绘制提取的差异的分布
plot.evenSample 样本沿梯度的曲线分布
plot.logitreg 产生模拟逻辑回归模型的曲线图
plot.mat mat对象的打印诊断
plot.mcarlo 蒙特卡罗模拟相异分布图
plot.minDC 每个样本的最小不相似性图
plot.prcurve 在PCA空间中绘制拟合主曲线
plot.rankDC 环境和物种差异的等级相关。
plot.residLen 剩余长度绘图法
plot.roc 绘制ROC曲线和相关诊断
plot.sppResponse 沿梯度或潜变量绘制物种反应图
plot.timetrack 物种组成变化的时间轨迹
plot.wa 加权平均模型的绘图诊断
plot.weightedCor WA重建的加权相关检验
points.timetrack 物种组成变化的时间轨迹
Pollen 北美现代花粉数据库
prcurve 将主曲线拟合到m维数据
predict.logitreg 化石样品相似性的后验概率
predict.mat 现代模拟技术模型的预测方法
predict.pcr 主成分回归预测值
predict.prcurve 在主曲线上以99999拟合值预测新闻位置
predict.timetrack 物种组成变化的时间轨迹
predict.wa 从加权平均模型预测
print.analog 模拟匹配
print.bayesF 贝叶斯因子
print.bootstrap.mat Bootstrap估计及其误差
print.bootstrap.wa WA模型的Bootstrap估计及其误差
print.cma 近现代类比
print.crossval 古生态传递函数模型的交叉验证
print.fitted.bootstrap.mat Bootstrap估计及其误差
print.fitted.mat 现代模拟技术传递函数模型
print.logitreg 用于评估类似物/非类似物的Logistic回归模型
print.mat 现代模拟技术传递函数模型
print.mcarlo 相异性的蒙特卡罗模拟
print.minDC 提取最小差异
print.optima 加权平均最优值和公差范围
print.pcr 主成分回归传递函数模型
print.performance 传递函数模型性能统计
print.prcurve 将主曲线拟合到m维数据
print.predict.mat 现代模拟技术模型的预测方法
print.predict.wa 从加权平均模型预测
print.rankDC 环境和物种差异的等级相关。
print.residLen 平方剩余长度诊断
print.residuals.bootstrap.mat Bootstrap估计及其误差
print.residuals.mat 现代模拟技术传递函数模型
print.roc ROC曲线分析
print.summary.analog 总结模拟匹配结果
print.summary.bootstrap.mat 总结MAT模型的引导重采样
print.summary.cma 总结近现代类似物的提取
print.summary.logitreg 用于评估类似物/非类似物的Logistic回归模型
print.summary.mat 总结现代模拟技术模型
print.summary.predict.mat 总结MAT模型预测
print.summary.roc ROC曲线分析
print.timetrack 物种组成变化的时间轨迹
print.tolerance 加权平均最优值和公差范围
print.wa 加权平均传递函数
print.weightedCor WA重建的加权相关检验
rankDC 环境和物种差异的等级相关。
reconPlot 古环境重建的地层图
reconPlot.default 古环境重建的地层图
reconPlot.predict.mat 古环境重建的地层图
reconPlot.predict.wa 古环境重建的地层图
resid.bootstrap.mat Bootstrap估计及其误差
resid.mat 现代模拟技术传递函数模型
resid.prcurve 主曲线拟合的残差。
residLen 平方剩余长度诊断
residuals.bootstrap.mat Bootstrap估计及其误差
residuals.mat 现代模拟技术传递函数模型
residuals.pcr 主成分回归传递函数模型
residuals.prcurve 主曲线拟合的残差。
residuals.wa 加权平均传递函数
rlgh 格伦黑德硅藻环湖
RMSEP 预测均方根误差
RMSEP.bootstrap.mat 预测均方根误差
RMSEP.bootstrap.wa 预测均方根误差
RMSEP.default 预测均方根误差
RMSEP.mat 预测均方根误差
roc ROC曲线分析
roc.analog ROC曲线分析
roc.default ROC曲线分析
roc.mat ROC曲线分析
Salinity Imbrie和Kipp有孔虫训练集
scores.prcurve 类“prcurve”的主曲线对象的“scores”方法。
scores.timetrack 物种组成变化的时间轨迹
screeplot.bootstrap.mat 模型结果的尖叫图
screeplot.mat 模型结果的尖叫图
screeplot.pcr 主成分回归传递函数模型
setK 提取并设置类似物的数量
setK 提取并设置类似物的数量
setK 提取并设置类似物的数量
smoothGAM 用于拟合主曲线的更平滑的插件函数
smoothSpline 用于拟合主曲线的更平滑的插件函数
splitSample 沿环境梯度选择样本
sppResponse 物种沿梯度的反应。
sppResponse.prcurve 物种沿梯度的反应。
sqrlLinear 平方剩余长度诊断
sqrlUnimodal 平方剩余长度诊断
stdError 拟合值与预测值的标准差
stdError.mat 拟合值与预测值的标准差
stdError.predict.mat 拟合值与预测值的标准差
Stratiplot 古生态地层图
Stratiplot.default 古生态地层图
Stratiplot.formula 古生态地层图
Stratiplot.matrix 古生态地层图
summary.analog 总结模拟匹配结果
summary.bootstrap.mat 总结MAT模型的引导重采样
summary.cma 总结近现代类似物的提取
summary.logitreg 用于评估类似物/非类似物的Logistic回归模型
summary.mat 总结现代模拟技术模型
summary.predict.mat 总结MAT模型预测
summary.roc ROC曲线分析
SumSST Imbrie和Kipp有孔虫训练集
swapdiat 交换亚化石硅藻和pH训练集
swappH 交换亚化石硅藻和pH训练集
tail.join 合并公共列上的物种数据集(物种)
timetrack 物种组成变化的时间轨迹
tolerance.default 加权平均最优值和公差范围
tran 通用数据转换和标准化
tran.default 通用数据转换和标准化
tran.formula 通用数据转换和标准化
V12.122 Imbrie和Kipp有孔虫训练集
varExpl 排序轴解释的方差
varExpl.cca 排序轴解释的方差
varExpl.default 排序轴解释的方差
varExpl.prcurve 排序轴解释的方差
wa 加权平均传递函数
wa.default 加权平均传递函数
wa.formula 加权平均传递函数
waFit 加权平均传递函数
weightedCor WA重建的加权相关检验
weightedCor.default WA重建的加权相关检验
WinSST Imbrie和Kipp有孔虫训练集