R语言algaeClassify包说明文档(版本 1.2.0)

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accum 将具有二项式名称的数据帧列拆分为属和种列。样地物种丰富度随时间变化,生成物种累积曲线,并将SAC与模拟的理想曲线进行比较,假设所有唯一分类群在时间序列中的任何点具有相同的采样概率。(作者迪特马尔斯特莱尔)
algae_search 将一个属和种的名称与algaebase在线数据库进行比较
bestmatch 学名与可能匹配项列表之间的模糊部分匹配
date_mat 将浮游植物时间序列转换为丰度矩阵进行排序
genus_species_extract 将具有二项式名称的数据帧列拆分为属和种列。
lakegeneva 来自瑞士日内瓦湖的示例数据集
mean_naomit 忽略NA时计算平均值
phyto_ts_aggregate 基于丰度的浮游植物聚集时间序列。最多可以给出3个分组变量:例如属、种、stationid、深度范围。如果没有给出足够的变量,则将聚合为是否存在分组变量。
sampeff 直观地评估抽样工作随时间的变化(作者:Dietmar Straile)
spp_list_algaebase 将can函数应用于数据框包含浮游植物物种
traitranges Reynolds 1988和Reynolds 2006 CSR的表面/体积比和最大线性尺寸标准
traits_to_csr 根据Reynolds等人1988年和2006年提出的表面体积比和最大线性尺寸范围,将浮游植物物种分配到CSR功能组
traits_to_csr_df 根据Reynolds et al.1988;2006提出的表面体积比和最大线性尺寸范围,将CSR功能组分类添加到浮游植物物种的数据框架中
traits_to_mfg 根据二元功能特性和分类法(类别和顺序)分配制造商
traits_to_mfg_df 将形态功能组分配给功能特性和更高分类的数据框架