| a.score | 主成分判别分析（DAPC）的a评分计算与优化 | ||
| addStrata | 访问和操作genind或genlight对象的填充层。 | ||
| addStrata-method | 访问和操作genind或genlight对象的填充层。 | ||
| addStrata | 访问和操作genind或genlight对象的填充层。 | ||
| addStrata | 访问和操作genind或genlight对象的填充层。 | ||
| adegenet | adegenet软件包 | ||
| adegenet.package | adegenet软件包 | ||
| adegenetIssues | 访问adegenet在线资源的函数 | ||
| adegenetServer | adegenet的Web服务器 | ||
| adegenetTutorial | 访问adegenet在线资源的函数 | ||
| adegenetWeb | 访问adegenet在线资源的函数 | ||
| AIC.snapclust | 计算snapclust的Akaike信息标准（AIC） | ||
| AICc | 为snapclust计算小样本的Akaike信息准则（AICc） | ||
| AICc.snapclust | 为snapclust计算小样本的Akaike信息准则（AICc） | ||
| alignment2genind | 将数据从序列对齐导入到genind对象 | ||
| alleles | adegenet对象的访问器 | ||
| alleles-method | adegenet对象的访问器 | ||
| alleles-method | 正式班级“genlight” | ||
| alleles | adegenet对象的访问器 | ||
| alleles | adegenet对象的访问器 | ||
| alleles | 正式班级“genlight” | ||
| any2col | adegenet的辅助功能 | ||
| as-method | 正式班级“SNPbin” | ||
| as-method | 将genind/genpop对象转换为其他类 | ||
| as-method | 转换为“SNPbin”类 | ||
| as-method | 转换为“genlight”类 | ||
| as-method | 正式班级“genlight” | ||
| as.data.frame.genind | 将genind/genpop对象转换为其他类 | ||
| as.data.frame.genlight | 正式班级“genlight” | ||
| as.data.frame.genpop | 将genind/genpop对象转换为其他类 | ||
| as.genind | genind构造函数 | ||
| as.genlight | 转换为“genlight”类 | ||
| as.genlight-method | 转换为“genlight”类 | ||
| as.genpop | genpop构造函数 | ||
| as.genpop.genind | 将genind/genpop对象转换为其他类 | ||
| as.igraph.haploGen | 单倍型谱系的模拟 | ||
| as.igraph.seqTrack | 家谱重建的SeqTrack算法 | ||
| as.integer.SNPbin | 正式班级“SNPbin” | ||
| as.ktab.genind | 将genind/genpop对象转换为其他类 | ||
| as.ktab.genpop | 将genind/genpop对象转换为其他类 | ||
| as.lda | 主成分判别分析 | ||
| as.lda.dapc | 主成分判别分析 | ||
| as.list.genlight | 正式班级“genlight” | ||
| as.matrix.genind | 将genind/genpop对象转换为其他类 | ||
| as.matrix.genlight | 正式班级“genlight” | ||
| as.matrix.genpop | 将genind/genpop对象转换为其他类 | ||
| as.POSIXct.haploGen | 单倍型谱系的模拟 | ||
| as.seqTrack.haploGen | 单倍型谱系的模拟 | ||
| as.SNPbin | 转换为“SNPbin”类 | ||
| as.SNPbin-method | 转换为“SNPbin”类 | ||
| assignplot | 主成分判别分析用图形（DAPC） | ||
| azur | adegenet的辅助功能 | ||
| BIC.snapclust | 计算snapclust的贝叶斯信息准则（BIC） | ||
| binIntToBytes | 内部C例程 | ||
| bluepal | adegenet的辅助功能 | ||
| bytesToBinInt | 内部C例程 | ||
| bytesToInt | 内部C例程 | ||
| c.SNPbin | 正式班级“SNPbin” | ||
| callOrNULL-class | adegenet的虚拟类 | ||
| cbind.genlight | 正式班级“genlight” | ||
| cbind.SNPbin | 正式班级“SNPbin” | ||
| charOrNULL-class | adegenet的虚拟类 | ||
| CheckAllSeg | 内部C例程 | ||
| checkType | adegenet的辅助功能 | ||
| chooseCN | 函数选择连接网络 | ||
| chr | 正式班级“genlight” | ||
| chr-method | 正式班级“genlight” | ||
| chr | 正式班级“genlight” | ||
| chr | 正式班级“genlight” | ||
| chromosome | 正式班级“genlight” | ||
| chromosome-method | 正式班级“genlight” | ||
| chromosome | 正式班级“genlight” | ||
| chromosome | 正式班级“genlight” | ||
| coerce-method | 正式班级“SNPbin” | ||
| coerce-method | 将genind/genpop对象转换为其他类 | ||
| coerce-method | 转换为“SNPbin”类 | ||
| coerce-method | 转换为“genlight”类 | ||
| coerce-method | 正式班级“genlight” | ||
| colorplot | 用颜色表示点云 | ||
| colorplot.default | 用颜色表示点云 | ||
| colorplot.spca | 空间主成分分析 | ||
| compoplot | 基因型组成图 | ||
| compoplot.dapc | 基因型组成图 | ||
| compoplot.matrix | 基因型组成图 | ||
| compoplot.snapclust | 基因型组成图 | ||
| coords.monmonier | 返回“monmonier”类的对象的结果路径中的原始点 | ||
| corner | adegenet的辅助功能 | ||
| dapc | 主成分判别分析 | ||
| dapc.data.frame | 主成分判别分析 | ||
| dapc.dudi | 主成分判别分析 | ||
| dapc.genind | 主成分判别分析 | ||
| dapc.genlight | 主成分判别分析 | ||
| dapc.matrix | 主成分判别分析 | ||
| dapcIllus | 说明DAPC的模拟数据 | ||
| deepseasun | adegenet的辅助功能 | ||
| df2genind | 转换数据框等位基因数据到genind对象。 | ||
| dfOrNULL-class | adegenet的虚拟类 | ||
| dim-method | 正式班级“genlight” | ||
| dist-method | 群体等位基因计数的adegenet正式分类（S4） | ||
| dist.genpop | 群体间遗传距离 | ||
| DNAbin2genind | 将数据从序列对齐导入到genind对象 | ||
| eHGDP | 扩展HGDP-CEPH数据集 | ||
| export_to_mvmapper | mvmapper可视化的导出分析 | ||
| export_to_mvmapper.dapc | mvmapper可视化的导出分析 | ||
| export_to_mvmapper.default | mvmapper可视化的导出分析 | ||
| export_to_mvmapper.dudi | mvmapper可视化的导出分析 | ||
| export_to_mvmapper.spca | mvmapper可视化的导出分析 | ||
| extract.PLINKmap | 阅读PLINK单核苷酸多态性数据 | ||
| fac2col | adegenet的辅助功能 | ||
| factorOrNULL-class | adegenet的虚拟类 | ||
| fasta2DNAbin | 把大的DNA序列读入R | ||
| fasta2genlight | 从比对中提取单核苷酸多态性（SNPs） | ||
| find.clusters | 查找.cluster：使用连续K-均值进行聚类识别 | ||
| find.clusters.data.frame | 查找.cluster：使用连续K-均值进行聚类识别 | ||
| find.clusters.genind | 查找.cluster：使用连续K-均值进行聚类识别 | ||
| find.clusters.genlight | 查找.cluster：使用连续K-均值进行聚类识别 | ||
| find.clusters.matrix | 查找.cluster：使用连续K-均值进行聚类识别 | ||
| findMutations | 识别DNA序列之间的突变 | ||
| findMutations.DNAbin | 识别DNA序列之间的突变 | ||
| flame | adegenet的辅助功能 | ||
| formOrNULL-class | adegenet的虚拟类 | ||
| funky | adegenet的辅助功能 | ||
| gen-class | adegenet的虚拟类 | ||
| gengraph | 遗传传递图 | ||
| gengraph.default | 遗传传递图 | ||
| gengraph.dist | 遗传传递图 | ||
| gengraph.DNAbin | 遗传传递图 | ||
| gengraph.genind | 遗传传递图 | ||
| gengraph.genpop | 遗传传递图 | ||
| gengraph.matrix | 遗传传递图 | ||
| genind | genind构造函数 | ||
| genind-class | 个体基因型的adegenet正式类（S4） | ||
| genind2df | 将genind对象转换为数据框. | ||
| genind2genpop | 从genind到genpop对象的转换 | ||
| genlight | 正式班级“genlight” | ||
| genlight-class | 正式班级“genlight” | ||
| genpop | genpop构造函数 | ||
| genpop-class | 群体等位基因计数的adegenet正式分类（S4） | ||
| get.likelihood | 家谱重建的SeqTrack算法 | ||
| get.likelihood.seqTrack | 家谱重建的SeqTrack算法 | ||
| GLdotProd | 内部C例程 | ||
| glDotProd | genlight对象的辅助函数 | ||
| glMean | genlight对象的辅助函数 | ||
| glNA | genlight对象的辅助函数 | ||
| global.rtest | 全局和局部测试 | ||
| glPca | genlight目标的主成分分析 | ||
| glPlot | 打印灯光对象 | ||
| glSim | 简单genlight对象的模拟 | ||
| glSum | genlight对象的辅助函数 | ||
| GLsumFreq | 内部C例程 | ||
| GLsumInt | 内部C例程 | ||
| glVar | genlight对象的辅助函数 | ||
| graphMutations | 识别DNA序列之间的突变 | ||
| graphMutations.DNAbin | 识别DNA序列之间的突变 | ||
| greenpal | adegenet的辅助功能 | ||
| greypal | adegenet的辅助功能 | ||
| H3N2 | 季节性流感（H3N2）HA段数据 | ||
| haploGen | 单倍型谱系的模拟 | ||
| haploGen-class | 单倍型谱系的模拟 | ||
| hier | 访问和操作genind或genlight对象的填充层次结构。 | ||
| hier-method | 访问和操作genind或genlight对象的填充层次结构。 | ||
| hier | 访问和操作genind或genlight对象的填充层次结构。 | ||
| hier | 访问和操作genind或genlight对象的填充层次结构。 | ||
| Hs | 期望杂合度 | ||
| Hs.test | 预期杂合度（Hs）的测试差异 | ||
| HWE.test.genind | 多位点数据的Hardy-Weinberg平衡检验 | ||
| hybridize | 函数hybridize接受两个genind的输入，并生成两个对象中都有一个父对象的杂交个体。 | ||
| hybridpal | adegenet的辅助功能 | ||
| hybridtoy | 玩具混合数据集 | ||
| import2genind | 从多个软件向genind对象导入数据 | ||
| inbreeding | 基于似然的近亲繁殖估计 | ||
| indInfo-class | adegenet的虚拟类 | ||
| indNames | adegenet对象的访问器 | ||
| indNames-method | adegenet对象的访问器 | ||
| indNames-method | 正式班级“genlight” | ||
| indNames | adegenet对象的访问器 | ||
| indNames | adegenet对象的访问器 | ||
| indNames | 正式班级“genlight” | ||
| initialize,genind-methods | genind构造函数 | ||
| initialize,genpop-methods | genpop构造函数 | ||
| initialize-method | 正式班级“SNPbin” | ||
| initialize-method | 正式班级“genlight” | ||
| initialize-method | genind构造函数 | ||
| initialize-method | genpop构造函数 | ||
| intOrNULL-class | adegenet的虚拟类 | ||
| intOrNum-class | adegenet的虚拟类 | ||
| is.genind | 个体基因型的adegenet正式类（S4） | ||
| is.genpop | 群体等位基因计数的adegenet正式分类（S4） | ||
| isPoly | 评估genind/genpop对象的多态性 | ||
| isPoly-method | 评估genind/genpop对象的多态性 | ||
| isPoly-methods | 评估genind/genpop对象的多态性 | ||
| KIC | 为snapclust计算小样本的Akaike信息准则（AICc） | ||
| KIC.snapclust | 为snapclust计算小样本的Akaike信息准则（AICc） | ||
| ktab-class | 将genind/genpop对象转换为其他类 | ||
| labels.haploGen | 单倍型谱系的模拟 | ||
| lightseasun | adegenet的辅助功能 | ||
| listOrNULL-class | adegenet的虚拟类 | ||
| loadingplot | 用颜色表示点云 | ||
| loadingplot.default | 用颜色表示点云 | ||
| loadingplot.glPca | genlight目标的主成分分析 | ||
| local.rtest | 全局和局部测试 | ||
| locFac | adegenet对象的访问器 | ||
| locFac-method | adegenet对象的访问器 | ||
| locNames | adegenet对象的访问器 | ||
| locNames-method | adegenet对象的访问器 | ||
| locNames-method | 正式班级“genlight” | ||
| locNames | adegenet对象的访问器 | ||
| locNames | adegenet对象的访问器 | ||
| locNames | 正式班级“genlight” | ||
| makefreq | 计算等位基因频率 | ||
| makefreq,genind-methods | 计算等位基因频率 | ||
| makefreq,genpop-methods | 计算等位基因频率 | ||
| makefreq-method | 计算等位基因频率 | ||
| makefreq.genind | 计算等位基因频率 | ||
| makefreq.genpop | 计算等位基因频率 | ||
| microbov | 15个牛品种的微卫星基因型 | ||
| minorAllele | 计算次要等位基因频率 | ||
| monmonier | 基于Monmonier算法的边界检测 | ||
| NA.posi | 正式班级“genlight” | ||
| NA.posi-method | 正式班级“SNPbin” | ||
| NA.posi-method | 正式班级“genlight” | ||
| nAll | adegenet对象的访问器 | ||
| nAll-method | adegenet对象的访问器 | ||
| names-method | 正式班级“SNPbin” | ||
| names-method | 个体基因型的adegenet正式类（S4） | ||
| names-method | 正式班级“genlight” | ||
| names-method | 群体等位基因计数的adegenet正式分类（S4） | ||
| nameStrata | 访问和操作genind或genlight对象的填充层。 | ||
| nameStrata-method | 访问和操作genind或genlight对象的填充层。 | ||
| nameStrata | 访问和操作genind或genlight对象的填充层。 | ||
| nameStrata | 访问和操作genind或genlight对象的填充层。 | ||
| nancycats | 南希（法国）17个殖民地237只猫的微卫星基因型 | ||
| nb_shared_all | 内部C例程 | ||
| nInd | adegenet对象的访问器 | ||
| nInd-method | adegenet对象的访问器 | ||
| nInd-method | 正式班级“genlight” | ||
| nLoc | adegenet对象的访问器 | ||
| nLoc-method | 正式班级“SNPbin” | ||
| nLoc-method | adegenet对象的访问器 | ||
| nLoc-method | 正式班级“genlight” | ||
| nPop | adegenet对象的访问器 | ||
| nPop-method | adegenet对象的访问器 | ||
| nPop-method | 正式班级“genlight” | ||
| num2col | adegenet的辅助功能 | ||
| old2new | 将具有过时类的对象转换为新对象 | ||
| old2new_genind | 将具有过时类的对象转换为新对象 | ||
| old2new_genlight | 将具有过时类的对象转换为新对象 | ||
| old2new_genpop | 将具有过时类的对象转换为新对象 | ||
| optim.a.score | 主成分判别分析（DAPC）的a评分计算与优化 | ||
| optimize.monmonier | 基于Monmonier算法的边界检测 | ||
| other | adegenet对象的访问器 | ||
| other-method | adegenet对象的访问器 | ||
| other-method | 正式班级“genlight” | ||
| other | adegenet对象的访问器 | ||
| other | adegenet对象的访问器 | ||
| other | 正式班级“genlight” | ||
| pairDist | 成对距离图 | ||
| pairDist.default | 成对距离图 | ||
| pairDistPlot | 成对距离图 | ||
| pairDistPlot.default | 成对距离图 | ||
| pairDistPlot.dist | 成对距离图 | ||
| pairDistPlot.DNAbin | 成对距离图 | ||
| pairDistPlot.genind | 成对距离图 | ||
| pairDistPlot.matrix | 成对距离图 | ||
| ploidy | adegenet对象的访问器 | ||
| ploidy-method | 正式班级“SNPbin” | ||
| ploidy-method | adegenet对象的访问器 | ||
| ploidy-method | 正式班级“genlight” | ||
| ploidy | adegenet对象的访问器 | ||
| ploidy | 正式班级“SNPbin” | ||
| ploidy | adegenet对象的访问器 | ||
| ploidy | 正式班级“genlight” | ||
| plot-method | 打印灯光对象 | ||
| plot.genlight | 打印灯光对象 | ||
| plot.haploGen | 单倍型谱系的模拟 | ||
| plot.monmonier | 基于Monmonier算法的边界检测 | ||
| plot.seqTrack | 家谱重建的SeqTrack算法 | ||
| plot.spca | 空间主成分分析 | ||
| plotHaploGen | 单倍型谱系的模拟 | ||
| plotSeqTrack | 家谱重建的SeqTrack算法 | ||
| pop | adegenet对象的访问器 | ||
| pop-method | adegenet对象的访问器 | ||
| pop-method | 正式班级“genlight” | ||
| pop | adegenet对象的访问器 | ||
| pop | adegenet对象的访问器 | ||
| pop | 正式班级“genlight” | ||
| popInfo-class | adegenet的虚拟类 | ||
| popNames | adegenet对象的访问器 | ||
| popNames-method | adegenet对象的访问器 | ||
| popNames-method | 正式班级“genlight” | ||
| popNames | adegenet对象的访问器 | ||
| popNames | adegenet对象的访问器 | ||
| popNames | 正式班级“genlight” | ||
| position | 正式班级“genlight” | ||
| position-method | 正式班级“genlight” | ||
| position | 正式班级“genlight” | ||
| position | 正式班级“genlight” | ||
| predict.dapc | 主成分判别分析 | ||
| print-method | 个体基因型的adegenet正式类（S4） | ||
| print-method | 群体等位基因计数的adegenet正式分类（S4） | ||
| print.dapc | 主成分判别分析 | ||
| print.genindSummary | 个体基因型的adegenet正式类（S4） | ||
| print.genpopSummary | 群体等位基因计数的adegenet正式分类（S4） | ||
| print.glPca | genlight目标的主成分分析 | ||
| print.haploGen | 单倍型谱系的模拟 | ||
| print.monmonier | 基于Monmonier算法的边界检测 | ||
| print.spca | 空间主成分分析 | ||
| propShared | 计算共享等位基因的比例 | ||
| propTyped | 计算类型化元素的比例 | ||
| propTyped-method | 计算类型化元素的比例 | ||
| propTyped-methods | 计算类型化元素的比例 | ||
| rbind.genlight | 正式班级“genlight” | ||
| read.fstat | 从Fstat读取数据 | ||
| read.genepop | 从Genepop读取数据 | ||
| read.genetix | 从GENETIX读取数据 | ||
| read.PLINK | 阅读PLINK单核苷酸多态性数据 | ||
| read.plink | 阅读PLINK单核苷酸多态性数据 | ||
| read.snp | 读取单核苷酸多态性数据 | ||
| read.structure | 从结构中读取数据 | ||
| redpal | adegenet的辅助功能 | ||
| repool | 将多个基因型汇集到一个数据集中 | ||
| rupica | 法国包日山335只羚羊的微卫星基因型 | ||
| sample.haploGen | 单倍型谱系的模拟 | ||
| scaleGen | 计算标度等位基因频率 | ||
| scaleGen-method | 计算标度等位基因频率 | ||
| scaleGen-methods | 计算标度等位基因频率 | ||
| scatter.dapc | 主成分判别分析用图形（DAPC） | ||
| scatter.glPca | genlight目标的主成分分析 | ||
| screeplot.spca | 空间主成分分析 | ||
| seasun | adegenet的辅助功能 | ||
| selPopSize | 选择具有代表性的群体的基因型 | ||
| selPopSize-method | 选择具有代表性的群体的基因型 | ||
| selPopSize-methods | 选择具有代表性的群体的基因型 | ||
| seploc | 每个轨迹的单独数据 | ||
| seploc-method | 每个轨迹的单独数据 | ||
| seploc-methods | 每个轨迹的单独数据 | ||
| seppop | 每个群体的不同基因型 | ||
| seppop-method | 每个群体的不同基因型 | ||
| seppop-methods | 每个群体的不同基因型 | ||
| seqTrack | 家谱重建的SeqTrack算法 | ||
| seqTrack-class | 家谱重建的SeqTrack算法 | ||
| seqTrack.default | 家谱重建的SeqTrack算法 | ||
| seqTrack.haploGen | 单倍型谱系的模拟 | ||
| seqTrack.matrix | 家谱重建的SeqTrack算法 | ||
| setPop | 操纵genind对象的总体因子。 | ||
| setPop-method | 操纵genind对象的总体因子。 | ||
| setPop | 操纵genind对象的总体因子。 | ||
| setPop | 操纵genind对象的总体因子。 | ||
| show-method | 正式班级“SNPbin” | ||
| show-method | 个体基因型的adegenet正式类（S4） | ||
| show-method | 正式班级“genlight” | ||
| show-method | 群体等位基因计数的adegenet正式分类（S4） | ||
| showmekittens | 当你需要休息的时候。。。 | ||
| sim2pop | 两个地理参考群体的模拟基因型 | ||
| snapclust | 基于EM算法的最大似然遗传聚类 | ||
| snapclust.choose.k | 使用BIC选择snapclust的群集数 | ||
| SNPbin | 正式班级“SNPbin” | ||
| SNPbin-class | 正式班级“SNPbin” | ||
| snpposi.plot | 分析多态位点的位置 | ||
| snpposi.plot.DNAbin | 分析多态位点的位置 | ||
| snpposi.plot.integer | 分析多态位点的位置 | ||
| snpposi.plot.numeric | 分析多态位点的位置 | ||
| snpposi.test | 分析多态位点的位置 | ||
| snpposi.test.DNAbin | 分析多态位点的位置 | ||
| snpposi.test.integer | 分析多态位点的位置 | ||
| snpposi.test.numeric | 分析多态位点的位置 | ||
| snpzip | 结构单核苷酸多态性的鉴定 | ||
| spca | 空间主成分分析 | ||
| spca.data.frame | 空间主成分分析 | ||
| spca.default | 空间主成分分析 | ||
| spca.genind | 空间主成分分析 | ||
| spca.genpop | 空间主成分分析 | ||
| spca.matrix | 空间主成分分析 | ||
| spcaIllus | 说明sPCA的模拟数据 | ||
| spca_randtest | sPCA的蒙特卡罗检验 | ||
| spectral | adegenet的辅助功能 | ||
| splitStrata | 访问和操作genind或genlight对象的填充层。 | ||
| splitStrata-method | 访问和操作genind或genlight对象的填充层。 | ||
| splitStrata | 访问和操作genind或genlight对象的填充层。 | ||
| splitStrata | 访问和操作genind或genlight对象的填充层。 | ||
| strata | 访问和操作genind或genlight对象的填充层。 | ||
| strata-method | 访问和操作genind或genlight对象的填充层。 | ||
| strata | 访问和操作genind或genlight对象的填充层。 | ||
| strata | 访问和操作genind或genlight对象的填充层。 | ||
| summary-method | 个体基因型的adegenet正式类（S4） | ||
| summary-method | 群体等位基因计数的adegenet正式分类（S4） | ||
| summary.dapc | 主成分判别分析 | ||
| summary.spca | 空间主成分分析 | ||
| swallowtails | 加拿大阿尔伯塔省和不列颠哥伦比亚省40个种群781只燕尾蝶的微卫星基因型 | ||
| tab | 访问等位基因计数或频率 | ||
| tab,genind-methods | 访问等位基因计数或频率 | ||
| tab,genpop-methods | 访问等位基因计数或频率 | ||
| tab-method | 正式班级“genlight” | ||
| tab-method | 访问等位基因计数或频率 | ||
| tab.genind | 访问等位基因计数或频率 | ||
| tab.genpop | 访问等位基因计数或频率 | ||
| transp | adegenet的辅助功能 | ||
| truenames | 还原对象的真实标签 | ||
| truenames-method | 还原对象的真实标签 | ||
| truenames-methods | 还原对象的真实标签 | ||
| USflu | 季节性流感（H3N2）HA段数据 | ||
| usflu | 季节性流感（H3N2）HA段数据 | ||
| USflu.fasta | 季节性流感（H3N2）HA段数据 | ||
| usflu.fasta | 季节性流感（H3N2）HA段数据 | ||
| virid | adegenet的辅助功能 | ||
| wasp | adegenet的辅助功能 | ||
| xvalDapc | 主成分判别分析的交叉验证（DAPC） | ||
| xvalDapc.data.frame | 主成分判别分析的交叉验证（DAPC） | ||
| xvalDapc.default | 主成分判别分析的交叉验证（DAPC） | ||
| xvalDapc.genind | 主成分判别分析的交叉验证（DAPC） | ||
| xvalDapc.genlight | 主成分判别分析的交叉验证（DAPC） | ||
| xvalDapc.matrix | 主成分判别分析的交叉验证（DAPC） | ||
| $-method | 正式班级“SNPbin” | ||
| $-method | adegenet对象的访问器 | ||
| $-method | 正式班级“genlight” | ||
| $ | 正式班级“SNPbin” | ||
| $ | adegenet对象的访问器 | ||
| $ | 正式班级“genlight” | ||
| .find.sub.clusters | 查找.cluster：使用连续K-均值进行聚类识别 | ||
| .genlab | adegenet的辅助功能 | ||
| .internal_C_routines | 内部C例程 | ||
| .readExt | adegenet的辅助功能 | ||
| .rmspaces | adegenet的辅助功能 | ||
| .valid.genind | 个体基因型的adegenet正式类（S4） | ||
| [-method | 正式班级“SNPbin” | ||
| [-method | adegenet对象的访问器 | ||
| [-method | 正式班级“genlight” | ||
| [.haploGen | 单倍型谱系的模拟 |