R语言aaSEA包说明文档(版本 1.1.0)

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AAindex 一个从AAindex得到的533个氨基酸特性的数据框。
corSubFile 相关站点的数据帧。
Cruciani 20种氨基酸的3种鲫鱼特性的数据框。
Fasgai 由6个Fasgai载体组成的20个氨基酸的数据帧。
getAASub 从多重序列比对中获得氨基酸替换
getCorPropChange 获取与相关替换关联的属性更改
getCorSites 获取具有替换的相关站点
getPropChange 获得野生型和取代氨基酸性质及相关性质变化
getPropCorr 多序列比对共进化柱的氨基酸性质相关性研究
getTopSub 在那个位置得到一个以上相关替换的位点,而不是保守氨基酸
Kidera 20个氨基酸的10个Kidera因子的数据框架
matEncode 函数对具有所需属性的对齐矩阵的相关列进行编码
plotCorNet 相关替代对的简单交互网络图
plotCorSubChanges 绘制具有选定属性相关性的共进化位点
plotMultiSubChange 绘制每个站点多个替代相关变化的热图
plotSingleSubChange 绘制单个替换变化直方图
startSeaShiny Title允许启动和运行应用程序