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aSPU |
单性状-单核苷酸多态性集关联的加权评分(SPU)和适应性SPU(aSPU)检验。 |
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aSPUd |
基于渐近分布的自适应加权和(SPU)检验(SPU和aSPU)。 |
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aSPUpath |
基于路径的单性状-路径关联能力得分和检验(SPUpath)和适应性SPUpath检验(aSPUpath)。 |
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aSPUpath2 |
基于路径的单性状-路径关联能力得分和检验(SPUpath)和适应性SPUpath检验(aSPUpath)。(矢量版本,n大时快速) |
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aSPUr |
数量性状的稳健加权和(SPU)检验和aSPU检验 |
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aSPUs |
单一性状-单核苷酸多态性集与GWAS汇总统计相关的加权评分(SPUs)和适应性SPU(aSPUs)检验。 |
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aSPUsD |
单一性状-单核苷酸多态性集与GWAS汇总统计(基于分布)关联的加权综合得分(SPUs)检验和适应性SPU(aSPUs)检验。 |
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aSPUsPath |
基于路径的动力评分和检验(SPUsPath)和适应性SPUsPath检验(aSPUsPath)与GWAS汇总统计的单性状-路径关联。 |
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aSPUsPath2 |
基于路径的动力评分和检验(SPUsPath)和适应性SPUsPath检验(aSPUsPath)与GWAS汇总统计的单性状-路径关联。(矢量版本,n大时快速) |
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aSPUw |
单性状-单核苷酸多态性集合关联的方差加权加权加权和检验(SPUw)和自适应SPUw检验(aSPUw)。 |
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estcov |
埃斯特科夫 |
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exdat |
示例数据集 |
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GATES2 |
基于基因的关联测试,使用扩展Simes程序(GATES)进行单性状-单核苷酸多态性集关联 |
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GatesSimes |
盖茨Simes检验单性状-通路关联。 |
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GEEaSPU |
广义估计方程中多性状单SNP关联的SPU和aSPU检验。 |
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getlogitp |
在logistic回归模型中,基于Wald检验得到多个snp的p值。 |
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Hyst |
单性状-路径关联的HYST(HYST)检验 |
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kegg9 |
冠状动脉疾病(CAD)数据的子集 |
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minP |
minP测试。 |
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MTaSPUs |
多性状的SPU和aSPU测试-单一SNP关联和GWAS汇总统计。 |
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MTaSPUsSet |
多性状-单核苷酸多态性集与GWAS综合统计的基因多性状加权和(MTSPUsSet)检验和适应性MTSPUsSet(MTSPUsSet)检验。 |
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MTaSPUsSetPath |
利用GWAS汇总统计数据进行多性状-路径关联的多性状-路径综合得分测试(MTSPUsSetPath)和适应性MTSPUsSetPath(mtapussetpath)测试。 |
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MTaSPUsSetScore |
GWAS汇总统计多性状SNP集关联的基因多性状加权和(MTSPUsSetScore)检验和适应性MTSPUsSet(mtapusset)检验。(添加分数版本) |
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plotPmat |
P值矩阵的图像图。 |
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pruneSNP |
修剪SNPs(与aSPUs、aSPUsPath、MTaSPUsSet相关) |
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SAMD11 |
MTaSPUsSet测试数据示例 |
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simPathAR1Snp |
用多个snp模拟一条通路。 |
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someGs |
MTaSPUsSet测试数据示例 |