| TreePar-package | 基于系统发育学的出生率和死亡率估计 | ||
| addroot | addroot：将根边祖先添加到第一个分支事件。 | ||
| bd.age.optim.matlab | bd.age.optim公司matlab：估计物种形成率和系统发育中与年龄相关的灭绝率。 | ||
| bd.densdep.optim | bd.densdep.optim公司：在依赖密度的物种形成模型下估计系统发育中的最大似然物种形成和灭绝率。 | ||
| bd.shifts.optim | bd.shifts.optim公司：估计物种形成和灭绝率变化以及系统发育中的大灭绝事件。 | ||
| bd.shifts.plot | bd.shifts.plot图：绘制通过函数获得的多样化率估计值bd.shifts.optim公司. | ||
| bdsky.stt.optim | bdsky.stt.optim公司：用顺序取样的尖端估计系统发育中的分段恒定出生率和死亡率。 | ||
| create.mat | 创建.mat：为LikAge和bd.age.optim公司.matlab。 | ||
| get.groups | 获取组：为生成输入bd.shifts.optim公司当群！=0. | ||
| LikAge | LikAge：在一个年龄相关的灭绝模型下，根据树的年龄，计算一个超度量系统发育的物种形成和灭绝率的可能性。 | ||
| LikConstant | LikConstant：计算给定系统发育树的恒定出生率和死亡率的可能性。 | ||
| LikConstantn | LikConstantn：计算给定系统发育树的恒定出生率和死亡率的可能性。 | ||
| LikDD | LikDD：根据树的年龄，在密度依赖的物种形成模型条件下，计算超度量系统发育的物种形成可能性和灭绝率。 | ||
| LikShifts | LikShifts：在给定系统发育树的情况下，计算与时间相关的出生率和死亡率的可能性。 | ||
| LikShiftsPP | LikShiftsPP：在给定系统发育树的情况下，计算与时间相关的出生率和死亡率的可能性。 | ||
| LikShiftsSTT | LikShiftsSTT：计算一个给定的系统发育树的出生率和死亡率分段不变的可能性。 | ||
| LikTypesSTT | LikTypesSTT：计算给定树的2型生灭模型参数的可能性。 | ||
| TreePar | 基于系统发育学的出生率和死亡率估计 |