| diphiseq | 主要功能。对于大多数用户来说，这个函数就是他们进行分析所需要的。 | ||
| example_data | 示例数据的数字计数矩阵。 | ||
| outprop | 根据DiPhiSeq的结果对数据中异常值的比例进行了粗略估计。 | ||
| robnb | 计算β和φ的估计值和标准误差。它从一组样本中获取单个基因的输入计数。这个函数是整个包的核心下划线函数。代码的重要部分是根据威廉H.艾伯哈德的glmrob.nb公司我们非常感谢他们在网上分享他们的代码。此函数还实现了我们提交的关于DiPhiSeq的论文中的算法1。此函数由robtest调用。大多数用户不需要直接调用这个函数。 | ||
| robtest | 调用robnb函数来估计系数，然后构造DD和DE的统计检验。它适用于单个基因。y1和y2是单个基因的计数载体。diphiseq调用此函数为每个基因进行计算。普通用户通常不需要直接使用这个功能。 |