Alphabet | 内置字母表 | ||
alphabet.dna | DNA字母表 | ||
alphabet.dna.gap | 带间隙的DNA字母表 | ||
alphabet.protein | 氨基酸字母表 | ||
alphabet.protein.gap | 带间隙的氨基酸字母表 | ||
alphabet.rna | RNA字母表 | ||
alphabet.rna.gap | 带间隙的RNA字母表 | ||
colorchart | 绘制一组序列的颜色图表示。 | ||
deprects | 平均颜色矩形 | ||
DLData | 创建“DLData”对象 | ||
filter.by.conservation | 按守恒筛选列(序列位置) | ||
filter.by.dependencies | 按依赖项筛选列(序列位置) | ||
filter.by.gaps | 按间隙过滤列(序列位置) | ||
filterColumns | 通过某些筛选函数筛选数据列 | ||
getDeps | 计算位置之间的相关性 | ||
getPWM | DLData对象的位置权重矩阵 | ||
logo | 序列标志 | ||
partition | 大多数相互依赖位置的分区数据 | ||
plotBlocks | 绘制数据块 | ||
plotDeparcs | 绘制依赖关系值的图形表示。 | ||
plotDeplogo | 绘制依赖项徽标 | ||
plotDepmatrix | 绘制依赖关系值的矩阵表示。 | ||
replaceColors | 替换DLData对象中的颜色 | ||
revcom | 反向补码 | ||
subBoxes | 将权重绘制为箱线图 | ||
subLines | 将权重绘制为线 | ||
suggestColors | 为符号建议颜色 | ||
summary.DLData | 总结DLData对象 |