| DSviaDRM-package | 从功能失调调节机制探讨疾病相似性 | ||
| comDCGL | 多种疾病中常见的DCGs和DCLs的分类 | ||
| comDCGLplot | 通用dcg和dcl的可视化 | ||
| DCEA | 根据“差异共表达分析”确定DCGs（差异共表达基因）和DCLs（差异共表达链） | ||
| DCpathway | 计算每个通路的差异共表达值（DC） | ||
| DS | 疾病相似性鉴定 | ||
| DSviaDRM | 从功能失调调节机制探讨疾病相似性 | ||
| expressionBasedfilter | 根据表达水平筛选基因 | ||
| exprs1 | 从GEO中提取的真实数据集(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi？acc=GSE22528） | ||
| exprs2 | 从GEO中提取的真实数据集(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi？acc=GSE35487） | ||
| exprs3 | 从GEO中提取的真实数据集(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi？acc=GSE9006） | ||
| pathways | 从MSigDB的两个集合下载的人类路径数据集 | ||
| tf2target | 人类转录因子数据集调控潜在的靶基因 | ||
| varianceBasedfilter | 根据表达变异性筛选基因 |