DLMtool-package | 数据有限方法工具箱 | ||
AAVE | 性能度量方法 | ||
AAVY | 性能度量方法 | ||
addMPs | MSE对象的实用函数 | ||
Albacore | 股票类对象 | ||
applyMP | 对类数据对象应用管理过程 | ||
Atlantic_mackerel | 数据类对象 | ||
avail | 此类的哪些对象可用 | ||
AvC | 平均捕获量 | ||
AvC_MLL | 有大小限制的平均捕获量 | ||
barplot.MSE | 绘制MSE结果的条形图 | ||
BK | 贝丁顿和柯克伍德生活史 | ||
BK_CC | 贝丁顿和柯克伍德生活史 | ||
BK_ML | 贝丁顿和柯克伍德生活史 | ||
Bluefin_tuna | 股票类对象 | ||
Bluefin_tuna_WAtl | 股票类对象 | ||
Blue_shark | 股票类对象 | ||
boxplot.Data | TAC建议的箱线图 | ||
Butterfish | 股票类对象 | ||
CALsimp | 简化了数据对象的校准槽 | ||
Can | 根据数据可用性确定管理程序(MPs) | ||
Cant | 根据数据可用性确定管理程序(MPs) | ||
CC | 基于年龄的捕获曲线 | ||
CC1 | Geromont和Butterworth(2015)恒定捕获量 | ||
CC2 | Geromont和Butterworth(2015)恒定捕获量 | ||
CC3 | Geromont和Butterworth(2015)恒定捕获量 | ||
CC4 | Geromont和Butterworth(2015)恒定捕获量 | ||
CC5 | Geromont和Butterworth(2015)恒定捕获量 | ||
cheatsheets | 打开DLMtool备忘单(需要internet连接) | ||
checkMSE | MSE对象的实用函数 | ||
China_rockfish | 数据类对象 | ||
ChkObj | 检查DLM对象是否有效 | ||
Choose | 手动映射运行模型历史期间的参数 | ||
ChooseEffort | 手动映射运行模型历史期间的参数 | ||
ChooseM | 手动映射运行模型历史期间的参数 | ||
ChooseSelect | 手动映射运行模型历史期间的参数 | ||
Cobia | 数据类对象 | ||
compplot | 随机SRA方法模拟测试的通用比较图 | ||
CompSRA | 年龄构成库存减少分析 | ||
CompSRA4010 | 年龄构成库存减少分析 | ||
condmet | 符合条件? | ||
Converge | 检查收敛性 | ||
COSEWIC_Blow | COSEWIC MSE使用正确的MPs和预计的时间范围运行 | ||
COSEWIC_Dplot | COSEWIC MSE使用正确的MPs和预计的时间范围运行 | ||
COSEWIC_Hplot | COSEWIC MSE使用正确的MPs和预计的时间范围运行 | ||
COSEWIC_Pplot | COSEWIC MSE使用正确的MPs和预计的时间范围运行 | ||
COSEWIC_report | COSEWIC MSE使用正确的MPs和预计的时间范围运行 | ||
COSEWIC_tab | COSEWIC MSE使用正确的MPs和预计的时间范围运行 | ||
COSEWIC_tab_formatted | COSEWIC MSE使用正确的MPs和预计的时间范围运行 | ||
Cos_thresh_tab | COSEWIC满足的当前默认阈值 | ||
cparscheck | runMSE的内部函数,用于检查OM slot cpars slot的格式是否正确 | ||
Cplot | 绘制与上一历史年相对的生物量和产量中值 | ||
CurC | Geromont和Butterworth(2015)恒定捕获量 | ||
curE | 以当前努力水平捕鱼 | ||
curE75 | 以当前努力水平捕鱼 | ||
DAAC | 消耗校正平均渔获量 | ||
Data-class | “数据”类 | ||
Data-class-objects | 数据类对象 | ||
Data2csv | 将数据对象转换为.csv数据文件 | ||
DataDescription | 数据描述 | ||
DataInit | 初始化数据输入文件 | ||
Data_xl | 从Excel电子表格读入数据对象 | ||
DBSRA | 基于损耗的库存减少分析 | ||
DBSRA4010 | 基于损耗的库存减少分析 | ||
DBSRA_40 | 基于损耗的库存减少分析 | ||
DCAC | 消耗校正平均渔获量 | ||
DCAC4010 | 消耗校正平均渔获量 | ||
DCACs | 消耗校正平均渔获量 | ||
DCAC_40 | 消耗校正平均渔获量 | ||
DCAC_ML | 消耗校正平均渔获量 | ||
DD | 延迟-差异库存评估 | ||
DD4010 | 延迟-差异库存评估 | ||
DDe | 基于努力的延迟-差异库存评估 | ||
DDe75 | 基于努力的延迟-差异库存评估 | ||
DDes | 基于努力的延迟-差异库存评估 | ||
DecE_Dom | 舰队类对象 | ||
DecE_HDom | 舰队类对象 | ||
DecE_NDom | 舰队类对象 | ||
DepF | FMSY/M比值法 | ||
DFO_bar | 渔业及海洋部鱼类资源状况条形图 | ||
DFO_hist | 渔业和海洋部 | ||
DFO_plot | 渔政及海洋处 | ||
DFO_plot2 | 渔业和海洋部默认地块2 | ||
DFO_proj | 渔业和海洋部投影图 | ||
DFO_quant | 渔业和海洋部生物量分位数图 | ||
DFO_report | 创建标准DFO MSE报告 | ||
DFO_spider | DFO性能蜘蛛图(前三个MPs) | ||
DFO_tab | 创建标准DFO性能表 | ||
DFO_tab_formatted | 标准DFO性能图的格式化版本,按阈值进行颜色编码 | ||
DLMDataDir | 计算机上已安装程序包的目录 | ||
DLMdiag | 根据数据可用性确定管理程序(MPs) | ||
DLMenv | DLMenv空白环境 | ||
DLMextra | 从DLMextra包加载更多数据 | ||
DLMtool | 数据有限方法工具箱 | ||
dnormal | 双正态选择性曲线 | ||
Dom | 确定主生产计划 | ||
DTe40 | 努力寻找一个固定的库存损耗目标 | ||
DTe50 | 努力寻找一个固定的库存损耗目标 | ||
DynF | 动态Fratio MP | ||
EtargetLopt | 努力目标最佳长度 | ||
Example_datafile | 数据类对象 | ||
Fadapt | 自适应弗拉蒂奥 | ||
Fdem | 人口统计学方法 | ||
Fdem_CC | 人口统计学方法 | ||
Fdem_ML | 人口统计学方法 | ||
Fease | MP可行性诊断 | ||
FlatE_Dom | 舰队类对象 | ||
FlatE_HDom | 舰队类对象 | ||
FlatE_NDom | 舰队类对象 | ||
Fleet-class | “舰队”级 | ||
Fleet-class-objects | 舰队类对象 | ||
FleetDescription | 车队描述 | ||
FMSYref | 参考管理程序 | ||
FMSYref50 | 参考管理程序 | ||
FMSYref75 | 参考管理程序 | ||
Fratio | FMSY/M比值法 | ||
Fratio4010 | FMSY/M比值法 | ||
Fratio_CC | FMSY/M比值法 | ||
Fratio_ML | FMSY/M比值法 | ||
GB_CC | Geromont和Butterworth常数捕获控制规则 | ||
GB_slope | Geromont和Butterworth指数坡度控制规则 | ||
GB_target | 格洛蒙特和巴特沃斯瞄准了CPUE和catch MP | ||
Gcontrol | G-控制MP | ||
Generic_DecE | 舰队类对象 | ||
Generic_FlatE | 舰队类对象 | ||
Generic_Fleet | 舰队类对象 | ||
Generic_IncE | 舰队类对象 | ||
Generic_Obs | Obs类对象 | ||
getclass | 获取对象类 | ||
getmov2 | 优化功能,找到一个运动模型,匹配用户指定的运动特征修改为Rcpp。 | ||
getsel | 计算选择性曲线 | ||
Growth2OM | 根据年龄数据生成von Bertalanffy生长参数的自举估计 | ||
Gulf_blue_tilefish | 数据类对象 | ||
HDAAC | 消耗校正平均渔获量 | ||
Herring | 股票类对象 | ||
Hist-class | “历史”类 | ||
hist2 | 直方图函数包装器 | ||
ICI | 指数置信区间 | ||
ICI2 | 指数置信区间 | ||
Imp-class | “Imp”类 | ||
Imp-class-objects | Imp类对象 | ||
ImpDescription | IMP描述 | ||
Imprecise_Biased | Obs类对象 | ||
Imprecise_Unbiased | Obs类对象 | ||
IncE_HDom | 舰队类对象 | ||
IncE_NDom | 舰队类对象 | ||
initialize | ~~函数“initialize”的方法~~ | ||
initialize-method | ~~函数“initialize”的方法~~ | ||
initialize-methods | ~~函数“initialize”的方法~~ | ||
Input | 函数运行一组输入控制方法 | ||
IOTC_plot | 印度洋金枪鱼委员会权衡图 | ||
Iratio | 平均指数比 | ||
Islope1 | 指数斜率跟踪 | ||
Islope2 | 指数斜率跟踪 | ||
Islope3 | 指数斜率跟踪 | ||
Islope4 | 指数斜率跟踪 | ||
IT10 | 迭代索引目标MP | ||
IT5 | 迭代索引目标MP | ||
Itarget1 | 增量索引目标MP | ||
Itarget1_MPA | Itarget1和MPA | ||
Itarget2 | 增量索引目标MP | ||
Itarget3 | 增量索引目标MP | ||
Itarget4 | 增量索引目标MP | ||
ItargetE1 | 增量索引目标MP-基于工作量 | ||
ItargetE2 | 增量索引目标MP-基于工作量 | ||
ItargetE3 | 增量索引目标MP-基于工作量 | ||
ItargetE4 | 增量索引目标MP-基于工作量 | ||
ITe10 | 基于目标工作的索引 | ||
ITe5 | 基于目标工作的索引 | ||
ITM | 基于自然死亡率的指标 | ||
joinData | 联接列表中的数据对象 | ||
joinMSE | MSE对象的实用函数 | ||
join_plots | 使用共享图例绘制多个绘图 | ||
Kplot | 神户图:F/FMSY和B/BMSY的逐投影图 | ||
L95target | 长度目标TAC MP | ||
LBSPR | 基于长度的SPR MPs | ||
LBSPR_MLL | 基于长度的SPR MPs | ||
LH2OM | 预测缺失的生命史参数 | ||
LHdatabase | LH数据库 | ||
Low_Effort_Non_Target | 舰队类对象 | ||
Lratio_BHI | Jardim等人2015年基于平均长度的指标MP | ||
Lratio_BHI2 | Jardim等人2015年基于平均长度的指标MP | ||
Lratio_BHI3 | Jardim等人2015年基于平均长度的指标MP | ||
LSRA | 使用SRA估计R0,以匹配当前的F估计值,并避免因库存量小而受到惩罚 | ||
LSRA2 | LSRA的另一个版本,它是filename_edges_strength的包装器,使用sapply返回正确类型的输出(模式) | ||
LSRA_MCMC_sim | 内部SRA MCMC CPP代码 | ||
LSRA_opt | LSRA和LSRA2函数的内估计函数 | ||
LstepCC1 | 步进常数捕捉 | ||
LstepCC2 | 步进常数捕捉 | ||
LstepCC3 | 步进常数捕捉 | ||
LstepCC4 | 步进常数捕捉 | ||
LstepCE1 | 循序渐进的持续努力 | ||
LstepCE2 | 循序渐进的持续努力 | ||
Ltarget1 | 长度目标TAC MP | ||
Ltarget2 | 长度目标TAC MP | ||
Ltarget3 | 长度目标TAC MP | ||
Ltarget4 | 长度目标TAC MP | ||
LtargetE1 | 长度目标TAE MP | ||
LtargetE4 | 长度目标TAE MP | ||
LTY | 性能度量方法 | ||
LW2OM | 根据数据估计长度-重量参数 | ||
Mackerel | 股票类对象 | ||
makeMeanMP | 创建一个平均多个主生产计划结果的主生产计划 | ||
makePerf | 将OM对象转换为没有观察或处理错误的对象 | ||
makeTransparent | 使颜色透明 | ||
matlenlim | 尺寸限制管理程序 | ||
matlenlim2 | 尺寸限制管理程序 | ||
MCD | 平均捕获损耗 | ||
MCD4010 | 平均捕获损耗 | ||
minlenLopt1 | 尺寸限制管理程序 | ||
ML2D | 渔获物平均长度的耗竭和F估计 | ||
movfit_Rcpp | Rcpp版本的优化函数,返回用户指定和计算的移动参数之间的平方差。 | ||
MPStats | 计算MP性能的统计信息 | ||
MPtype | 管理程序类型 | ||
MRnoreal | 空间封闭和分配管理程序 | ||
MRreal | 空间封闭和分配管理程序 | ||
MSE-class | “MSE”类 | ||
MSEDescription | MSE描述 | ||
Needed | 根据数据可用性确定管理程序(MPs) | ||
NFref | 参考管理程序 | ||
NOAA_plot | 国家海洋和大气管理局默认图1 | ||
NOAA_plot2 | 通用交易图函数 | ||
Obs-class | “Obs”类 | ||
Obs-class-objects | Obs类对象 | ||
ObsDescription | OBS描述 | ||
OM-class | “OM”级 | ||
OMDescription | OM描述 | ||
OMdoc | 生成OM文档报告 | ||
OMexample | 复制示例OM XL和OM文档 | ||
OMinit | 初始化操作模型 | ||
optCPU | 确定CPU的最佳数量 | ||
ourReefFish | 数据类对象 | ||
Overages | Imp类对象 | ||
P10 | 性能度量方法 | ||
P100 | 性能度量方法 | ||
P50 | 性能度量方法 | ||
Perfect_Imp | Imp类对象 | ||
Perfect_Info | Obs类对象 | ||
PerformanceMetric | 性能度量方法 | ||
plot.Data | 打印数据对象 | ||
plot.Fleet | 打印操作模型对象 | ||
plot.Hist | 打印操作模型对象 | ||
plot.Imp | 打印操作模型对象 | ||
plot.MSE | 打印MSE对象 | ||
plot.Obs | 打印操作模型对象 | ||
plot.OM | 打印操作模型对象 | ||
plot.pars | 打印操作模型对象 | ||
plot.Stock | 打印操作模型对象 | ||
plotFleet | 绘制舰队对象参数 | ||
plotFun | 打印打印功能 | ||
plotImp | 绘制实现对象参数 | ||
plotM | 图M-年龄和尺寸 | ||
plotMPA | 绘制历史空间闭合图 | ||
plotObs | 绘制观测对象参数 | ||
plotOFL | 供NOAA使用的通用OFL图 | ||
plotOM | 绘制操作模型(OM)对象参数 | ||
plotSelect | 绘制漏洞和保留曲线 | ||
plotStock | 打印库存对象参数 | ||
PMLimit | 创建性能限制和性能目标表 | ||
PMObj | 创建性能限制和性能目标表 | ||
PMobj-class | 用于存储数据以便使用数据限制方法进行分析的对象 | ||
PNOF | 性能度量方法 | ||
Porgy | 股票类对象 | ||
Pplot | F/FMSY和B/BMSY的逐投影图 | ||
Pplot2 | F/FMSY、B/BMSY、B/B0和产量的逐投影图 | ||
Precise_Biased | Obs类对象 | ||
Precise_Unbiased | Obs类对象 | ||
predictLH | 预测缺失的生命史参数 | ||
PWhisker | 性能晶须图 | ||
Rcontrol | 内在增长率 | ||
Rcontrol2 | 内在增长率 | ||
RealFease | 基于真实数据的MP可行性诊断 | ||
Rec-class | “Rec”级 | ||
Red_snapper | 数据类对象 | ||
Replace | 替换现有库存、车队、Obs或Imp对象 | ||
replic8 | 放大(复制)DLM数据对象以创建用于模拟/灵敏度测试的附加维度 | ||
Report | 生成数据报告 | ||
ReqData | 需求数据 | ||
Required | 什么管理程序需要什么数据 | ||
Rockfish | 股票类对象 | ||
runCOSEWIC | COSEWIC MSE使用正确的MPs和预计的时间范围运行 | ||
runInMP | 对数据对象运行输入控件。 | ||
runMP | 运行管理程序 | ||
runMSE | 进行管理战略评估 | ||
SBT1 | SBT简单MP | ||
SBT2 | SBT简单MP | ||
Sense | 敏感性分析 | ||
setup | 设置并行处理 | ||
show-method | 显示PM的输出 | ||
show-method | 显示单个MP建议的输出 | ||
simCAA | 模拟年龄数据 | ||
simCAL | 模拟捕获长度数据 | ||
SimulatedData | 模拟数据 | ||
Simulation_1 | 数据类对象 | ||
SketchFun | 手动绘制历史相对捕鱼努力轨迹。 | ||
slotlim | 尺寸限制管理程序 | ||
Snapper | 股票类对象 | ||
Sole | 股票类对象 | ||
SPmod | 基于剩余产量的渔获量限制修正值 | ||
SPMSY | 捕获趋势剩余生产MSY MP | ||
SPslope | 剩余产量的斜率 | ||
SPSRA | 剩余生产库存减少分析 | ||
SPSRA_ML | 剩余生产库存减少分析 | ||
SRAcomp | 随机SRA方法的小区模拟试验 | ||
SRAsim | 模拟年龄捕获和捕获历史数据以测试SRA方法 | ||
StochasticSRA | 操作模型的随机SRA构造 | ||
StochasticSRAcpp | 操作模型的随机SRA构造 | ||
Stock-class | “股票”类 | ||
Stock-class-objects | 股票类对象 | ||
StockDescription | 股票描述 | ||
STY | 性能度量方法 | ||
Sub | 通过管理程序(MP)或模拟来子集MSE对象。 | ||
SubCpars | OM cpars插槽的子集 | ||
SubOM | OM对象中的库存、车队、Obs或Imp对象的子集 | ||
summary-method | 数据对象摘要 | ||
summary-method | MSE对象摘要 | ||
TAC | 计算多个MP的TAC建议 | ||
TACfilter | TAC滤波器 | ||
Targeting_Small_Fish | 舰队类对象 | ||
Target_All_Fish | 舰队类对象 | ||
testOM | 测试OM | ||
Thresh_tab | 满足DFO的当前默认阈值 | ||
tinyErr | 消除观察、实施和过程错误 | ||
tinyErr-method | 消除观察、实施和过程错误 | ||
Toothfish | 股票类对象 | ||
Tplot | 通用交易图函数 | ||
Tplot2 | 通用交易图函数 | ||
Tplot2_old | MSE对象的折衷图 | ||
Tplot3 | 通用交易图函数 | ||
Tplot_old | MSE对象的折衷图 | ||
TradePlot | 通用交易图函数 | ||
TradePlot_old | 一般折衷图 | ||
Turing | 图灵试验 | ||
updateMSE | MSE对象的实用函数 | ||
userguide | 打开DLMtool用户指南 | ||
Uses | 查找使用特定数据槽的管理过程 | ||
validcpars | 有效的自定义参数(CPAR) | ||
VOI | 计算信息价值 | ||
VOI2 | 计算信息价值2 | ||
VOIplot | 信息的另一个价值 | ||
VOIplot2 | 利用PM函数求信息图的值 | ||
wormplot | 生物质虫草 | ||
writeCSV | 为对象编写csv的内部函数 | ||
XL2Data | 从Excel文件导入数据对象 | ||
XL2OM | 从Excel文件加载OM | ||
Yield | 性能度量方法 | ||
YPR | 每招募一人的产量分析,以获得FMSY代理F01 | ||
YPR_CC | 每招募一人的产量分析,以获得FMSY代理F01 | ||
YPR_ML | 每招募一人的产量分析,以获得FMSY代理F01 |