| DGCA-package | 差分基因相关分析的R程序包DGCA | ||
| adjustPVals | 调整p值的数字向量。 | ||
| ages_darmanis | 大脑样本年龄向量。 | ||
| bigEmpPVals | 使用速度优化排序，使用参考池分布计算观察到的p值和模拟的零检验统计量。 | ||
| corMats-class | 存储相关矩阵和相关信息的S4类。 | ||
| darmanis | 不同脑细胞类型的单细胞基因表达数据。 | ||
| dCorAvg | 得到平均经验微分相关。 | ||
| dCorClass | 分类差异相关性。 | ||
| dCorMats | 查找矩阵之间的微分相关性。 | ||
| dCorrs | 两种情况之间的差异相关性。 | ||
| dcPair-class | S4类，用于成对差分相关矩阵和相关信息。 | ||
| dcTopPairs | 为数据集中顶部差异相关的基因对创建数据框。 | ||
| ddcorAll | 调用DGCA成对管道。 | ||
| ddcorFindSignificant | 找到一组差异相关的基因符号。 | ||
| ddcorGO | 差异相关分类基因的基因本体。 | ||
| ddMEGENA | 使用MEGENA对DGCA结果进行网络分析的积分函数。 | ||
| ddplot | 创建一个热图，显示两种情况下的相关性。 | ||
| design_mat | 单细胞RNA序列样本细胞类型规格设计矩阵。 | ||
| DGCA | 差分基因相关分析的R程序包DGCA | ||
| extractModuleGO | 从模块GO分析中提取结果 | ||
| filterGenes | 从矩阵中筛选行。 | ||
| findGOTermEnrichment | 找到基因载体的GO富集（使用GOstats）。 | ||
| getCors | 计算微分相关计算所需的矩阵。 | ||
| getDCorPerm | 得到置换的分组相关和成对的差分相关。 | ||
| getDCors | 得到分组相关和成对差分相关。 | ||
| getGroupsFromDesign | 根据设计矩阵拆分输入矩阵。 | ||
| makeDesign | 从字符向量创建设计矩阵。 | ||
| matCorr | 计算相关矩阵。 | ||
| matCorSig | 计算相关矩阵p值。 | ||
| matNSamp | 查找非缺失值的数目。 | ||
| moduleDC | 计算模差连通性（MDC） | ||
| moduleGO | 执行模块GO特性关联 | ||
| pairwiseDCor | 计算两两微分相关。 | ||
| permQValue | 基于基于置换的经验空统计从DGCA类对象计算q值。 | ||
| plotCors | 在多种条件下绘制基因对相关图。 | ||
| plotGOOneGroup | 一种情况下的超几何富集试验的绘图结果。 | ||
| plotGOTwoGroups | 绘制超几何富集试验的结果，以比较两种情况。 | ||
| plotModuleGO | 使用ggplot2绘制从基于模块的GO富集分析中提取的结果。 | ||
| plotVals | 在多个条件下为单个基因创建整体值的点图。 | ||
| switchGenesToHGCN | 将基因载体转换为干净的HGNC符号。 | ||
| topDCGenes | 根据差异相关基因对的总数对基因进行排序。 |