R语言CytobankAPIstats包说明文档(版本 2.0)

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analyzedata 返回由输入指定的事件计数或原始中间值的矩阵。列对应于fcs文件,行对应于单元类型中的标记
asinnorm 计算矩阵相对于指定列的弧长比
calcperevent 计算感兴趣的细胞类型占细胞总数的百分比
CytobankAPIstatsGUI 导出已处理的事件和信令数据
filterfiles 按搜索词筛选fcs文件列表
get1status 基于单样本名称条件的过滤矩阵
get2status 根据每个文件的两个条件筛选矩阵列,例如患者状态、估计、时间点等。
getfcsfiles 从给定的实验中获取fcs ID号和样本名称
getmarkers 为感兴趣的通道获取适当的标记ID
getnewind 以所需顺序的行作为输出,重新排列信令结果矩阵
getpops 为感兴趣的总体获取适当的门集ID
getrawsignals 计算感兴趣的群体中细胞标记的未转换中位数
parseevents 修改从对的调用中获取的列表统计.事件矩阵的行对应于fcs文件,列对应于填充类型
parsestats 将调用的结果统计.概述并返回一个原始中位数矩阵,其中列对应于fcs文件,行对应于不同单元类型中的感兴趣分子
parsestatsmean 将调用的结果统计.概述并返回原始平均值矩阵,其中列对应于fcs文件,行对应于不同单元类型中的感兴趣分子
percentevent 计算给定实验的细胞群百分比