R语言Corbi包说明文档(版本 0.6-0)

返回R语言所有包列表

Corbi-package 基本生物信息学工具的集合
best_subnets 最佳子网
column 从矩阵中提取列
Corbi 基本生物信息学工具的集合
extend_subnets 从较小的子网扩展子网
get_adjusted_deg_diff 计算给定网络的调整度差
get_diff_ratio_net 构建差异表达比率网络
get_ratio_distribution 计算表达式比率分布
get_ratio_distribution2 计算表达式比率分布
get_ratio_variance 计算表达式比率方差
get_shortest_distances 计算无权网络的最短距离
get_subnets 所有有限大小的子网
kappa_score 科恩kappa评分
make_DEG_data 模拟差异表达基因数据(高斯)
make_DEG_data2 模拟差异表达基因数据(负二项式)
make_DEG_pattern 模拟差异表达基因模式
markrank 马克拉克
netDEG netDEG:差异表达基因鉴定方法
netDEG_pvalue 计算netDEG p值
net_align 基于条件随机场的网络对齐方法
net_query 基于条件随机场的网络查询方法
net_query_batch 基于条件随机场的网络查询方法
nnzero 子矩阵的非零值个数
pmultihyper 多元超几何分布
pmultinom 多项式分布
p_combine 计算组合p值
read_net 从文本文件读取网络信息
rmultihyper 多元超几何分布
simulate_dropout 模拟退出表达式数据
simulate_dropout2 模拟退出表达式数据
simulate_sample_groups 从带有标签的给定样本中模拟样本组
submatrix 从矩阵中提取子矩阵
URG_getFactor 计算URG方法的归一化因子
URG_normalize 使用给定因子规格化
write_net 将网络信息写入文本文件