| CHNOSZ-package | 地球化学热力学计算与图解 | ||
| aasum | 蛋白质的氨基酸组成 | ||
| add.OBIGT | 使用热力学数据库的函数 | ||
| add.protein | 蛋白质的氨基酸组成 | ||
| affinity | 生成反应的化学亲和力 | ||
| AkDi | 状态方程 | ||
| allparents | 从NCBI分类文件中提取数据 | ||
| aminoacids | 使用序列数据的函数 | ||
| as.chemical.formula | 使用化学公式的函数 | ||
| axis.label | 表示化学式和性质的函数 | ||
| basis | 定义基本种类 | ||
| basis.elements | 交换基种 | ||
| basis.logact | 交换基种 | ||
| berman | 矿物热力学性质 | ||
| bgamma | 水相活度系数 | ||
| buffer | 计算缓冲化学活度 | ||
| calculateDensity | 深部地下水（DEW）模型 | ||
| calculateEpsilon | 深部地下水（DEW）模型 | ||
| calculateGibbsOfWater | 深部地下水（DEW）模型 | ||
| calculateQ | 深部地下水（DEW）模型 | ||
| cgl | 状态方程 | ||
| check.OBIGT | 热力学数据校验功能 | ||
| checkEOS | 热力学数据校验功能 | ||
| checkGHS | 热力学数据校验功能 | ||
| CHNOSZ | 热力学数据库和系统设置 | ||
| convert | 转换单位的函数 | ||
| count.aa | 读取FASTA文件和从UniProt下载的功能 | ||
| count.elements | 解析化学式 | ||
| Cp_s_var | 水相状态参数的回归方程 | ||
| CV | 目标函数 | ||
| CVRMSD | 目标函数 | ||
| DDGmix | 目标函数 | ||
| def2gi | 使用BLAST输出文件的函数 | ||
| demos | 运行文档中的示例 | ||
| describe.basis | 表示化学式和性质的函数 | ||
| describe.property | 表示化学式和性质的函数 | ||
| describe.reaction | 表示化学式和性质的函数 | ||
| DEW | 深部地下水（DEW）模型 | ||
| DGinf | 目标函数 | ||
| DGmix | 目标函数 | ||
| DGtr | 目标函数 | ||
| diagram | 化学活性图 | ||
| dimSums | 用于多维数组的函数 | ||
| dPdTtr | 其他任务的功能 | ||
| dumpdata | 热力学数据校验功能 | ||
| E.units | 转换单位的函数 | ||
| element.mu | 交换基种 | ||
| entropy | 使用化学公式的函数 | ||
| eos | 状态方程 | ||
| EOScalc | 水相状态参数的回归方程 | ||
| EOScoeffs | 水相状态参数的回归方程 | ||
| EOSlab | 水相状态参数的回归方程 | ||
| EOSplot | 水相状态参数的回归方程 | ||
| EOSregress | 水相状态参数的回归方程 | ||
| EOSvar | 水相状态参数的回归方程 | ||
| eqdata | 从EQ6输出文件读取数据 | ||
| equil.boltzmann | 物种平衡化学活性 | ||
| equil.reaction | 物种平衡化学活性 | ||
| equilibrate | 物种平衡化学活性 | ||
| examples | 运行文档中的示例 | ||
| expect_maxdiff | 编写测试的函数 | ||
| expr.property | 表示化学式和性质的函数 | ||
| expr.species | 表示化学式和性质的函数 | ||
| expr.units | 表示化学式和性质的函数 | ||
| extdata | 额外数据 | ||
| find.tp | 化学活性图 | ||
| findit | 优化目标函数的网格搜索 | ||
| getnames | 从NCBI分类文件中提取数据 | ||
| getnodes | 从NCBI分类文件中提取数据 | ||
| getrank | 从NCBI分类文件中提取数据 | ||
| GHS | 使用化学公式的函数 | ||
| GHS_Tr | 其他任务的功能 | ||
| group.formulas | 蛋白质功能（其他计算） | ||
| hkf | 状态方程 | ||
| i2A | 使用化学公式的函数 | ||
| IAPWS95 | IAPWS-95水的性质 | ||
| ibasis | 交换基种 | ||
| id.blast | 使用BLAST输出文件的函数 | ||
| info | 搜索热力学数据库 | ||
| ionize.aa | 蛋白质的电离特性 | ||
| label.figure | 创建和修改绘图的函数 | ||
| label.plot | 创建和修改绘图的函数 | ||
| lex | 用于生成图例文本的函数 | ||
| list2array | 用于多维数组的函数 | ||
| lNaCl | 用于生成图例文本的函数 | ||
| logact | 目标函数 | ||
| lP | 用于生成图例文本的函数 | ||
| lS | 用于生成图例文本的函数 | ||
| lT | 用于生成图例文本的函数 | ||
| lTP | 用于生成图例文本的函数 | ||
| makeup | 解析化学式 | ||
| mash | 多金属系统的组合图 | ||
| mass | 使用化学公式的函数 | ||
| maxdiff | 编写测试的函数 | ||
| mix | 多金属系统的组合图 | ||
| mod.buffer | 计算缓冲化学活度 | ||
| mod.OBIGT | 使用热力学数据库的函数 | ||
| moles | 物种平衡化学活性 | ||
| mosaic | 基种变化的化学亲和力 | ||
| MP90.cp | 蛋白质功能（其他计算） | ||
| mtitle | 创建和修改绘图的函数 | ||
| NaCl | 简单氯化钠水溶液 | ||
| nonideal | 水相活度系数 | ||
| nucleic.complement | 使用序列数据的函数 | ||
| nucleic.formula | 使用序列数据的函数 | ||
| OBIGT | 热力学数据库和系统设置 | ||
| objective | 目标函数 | ||
| P.units | 转换单位的函数 | ||
| palply | 条件并行处理 | ||
| parent | 从NCBI分类文件中提取数据 | ||
| pearson | 目标函数 | ||
| pinfo | 蛋白质热力学性质综述 | ||
| plot_findit | 优化目标函数的网格搜索 | ||
| protein.basis | 蛋白质热力学性质综述 | ||
| protein.equil | 蛋白质热力学性质综述 | ||
| protein.formula | 蛋白质热力学性质综述 | ||
| protein.info | 蛋白质热力学性质综述 | ||
| protein.length | 蛋白质热力学性质综述 | ||
| protein.OBIGT | 蛋白质热力学性质综述 | ||
| qqr | 目标函数 | ||
| ratlab | 表示化学式和性质的函数 | ||
| read.blast | 使用BLAST输出文件的函数 | ||
| read.fasta | 读取FASTA文件和从UniProt下载的功能 | ||
| rebalance | 多金属系统的组合图 | ||
| reset | 热力学数据库和系统设置 | ||
| retrieve | 按元素检索物种 | ||
| revisit | 目标函数的作图与优化 | ||
| RH2OBIGT | 热力学数据校验功能 | ||
| rho.IAPWS95 | 水和蒸汽性质函数 | ||
| richness | 目标函数的作图与优化 | ||
| RMSD | 目标函数 | ||
| sciname | 从NCBI分类文件中提取数据 | ||
| SD | 目标函数 | ||
| seq2aa | 蛋白质的氨基酸组成 | ||
| shannon | 目标函数 | ||
| slice | 用于多维数组的函数 | ||
| slice.affinity | 用于多维数组的函数 | ||
| solubility | 物种平衡化学活性 | ||
| spearman | 目标函数 | ||
| species | 感兴趣的物种 | ||
| subcrt | 物种和反应的性质 | ||
| swap.basis | 交换基种 | ||
| syslab | 表示化学式和性质的函数 | ||
| T.units | 转换单位的函数 | ||
| taxonomy | 从NCBI分类文件中提取数据 | ||
| thermo | 热力学数据库和系统设置 | ||
| thermo.axis | 创建和修改绘图的函数 | ||
| thermo.plot.new | 创建和修改绘图的函数 | ||
| thermo.refs | 热力学数据校验功能 | ||
| Ttr | 其他任务的功能 | ||
| uniprot.aa | 读取FASTA文件和从UniProt下载的功能 | ||
| unitize | 其他任务的功能 | ||
| usrfig | 创建和修改绘图的函数 | ||
| util.array | 用于多维数组的函数 | ||
| util.blast | 使用BLAST输出文件的函数 | ||
| util.data | 热力学数据校验功能 | ||
| util.expression | 表示化学式和性质的函数 | ||
| util.fasta | 读取FASTA文件和从UniProt下载的功能 | ||
| util.formula | 使用化学公式的函数 | ||
| util.legend | 用于生成图例文本的函数 | ||
| util.list | 使用列表的函数 | ||
| util.misc | 其他任务的功能 | ||
| util.plot | 创建和修改绘图的函数 | ||
| util.protein | 蛋白质功能（其他计算） | ||
| util.seq | 使用序列数据的函数 | ||
| util.test | 编写测试的函数 | ||
| util.units | 转换单位的函数 | ||
| util.water | 水和蒸汽性质函数 | ||
| V_s_var | 水相状态参数的回归方程 | ||
| water | 水的性质 | ||
| water.AW90 | 水和蒸汽性质函数 | ||
| water.DEW | 水的性质 | ||
| water.IAPWS95 | 水的性质 | ||
| water.lines | 创建和修改绘图的函数 | ||
| water.SUPCRT92 | 水的性质 | ||
| which.pmax | 使用列表的函数 | ||
| WP02.auxiliary | 水和蒸汽性质函数 | ||
| write.blast | 使用BLAST输出文件的函数 | ||
| ZC | 使用化学公式的函数 | ||
| ZC.col | 创建和修改绘图的函数 |