| BinMatInput_ordination | 包含合并二进制矩阵和分组信息的输入数据示例 | ||
| BinMatInput_reps | 包含包含复制样本对的二进制矩阵的示例输入数据 | ||
| check.data | 检查二进制矩阵中不需要的字符。 | ||
| consolidate | 在二进制矩阵中合并复制对。 | ||
| errors | 计算Jaccard和Euclidean错误率。 | ||
| group.names | 输出输入文件中指定的用于创建nMDS绘图的组名。 | ||
| nmds | 创建非度量多维缩放图（nMDS）。 | ||
| peak.remove | 移除峰值等于或小于指定阈值的样本。 | ||
| peaks.consolidated | 计算合并数据集的峰值数（总计、最大值和最小值）。 | ||
| peaks.original | 计算包含所有复制（总计、最大值和最小值）的数据集的峰值数。 | ||
| scree | 绘制屏幕图。 | ||
| shepard | 创建谢泼德图。 | ||
| upgma | 绘制层次聚类树（UPGMA）。 |