| BeviMed-package | 孟德尔病变异性受累的贝叶斯评估 | ||
| BeviMed | 孟德尔病变异性受累的贝叶斯评估 | ||
| bevimed | 孟德尔病变异性受累的贝叶斯评估 | ||
| bevimed_m | 在gamma=1模型下，以继承模式为条件进行推理 | ||
| bevimed_polytomous | 多关联模型的模型选择 | ||
| call_cpp | BeviMed c++MCMC程序的R接口 | ||
| CI_gamma1_evidence | 边际似然估计的置信区间 | ||
| conditional_prob_pathogenic | 根据遗传方式计算变异的致病概率。 | ||
| expected_explained | 计算预期解释案例数 | ||
| explaining_variants | 计算病例中致病性变体的预期数量 | ||
| extract_conditional_prob_pathogenic | 给定关联模型下变异条件致病性概率的提取 | ||
| extract_expected_explained | 提取预期解释案例数 | ||
| extract_explaining_variants | 提取病例中预期数量的致病性变体 | ||
| extract_gamma1_evidence | 提取模型gamma=1的证据 | ||
| extract_prob_association | 提取关联的后验概率 | ||
| extract_prob_pathogenic | 提取致病性的变异边际概率 | ||
| gamma0_evidence | 计算模型γ=0时观察病例对照状态y的边际概率 | ||
| gamma1_evidence | 计算模型gamma=1下的证据 | ||
| log_BF | 计算具有给定继承模式的关联模型和gamma=0的模型之间的对数贝叶斯因子 | ||
| print.BeviMed | 打印“BeviMed”对象的可读摘要 | ||
| print.BeviMed_m | 打印filename_points_covered_by_landmarks对象 | ||
| print.BeviMed_summary | 打印filename_points_covered_by_landmarks对象的可读摘要。 | ||
| prob_association | 计算关联概率 | ||
| prob_association_m | 计算一种遗传方式的关联概率 | ||
| prob_pathogenic | 计算城市的变异边际概率 | ||
| stack_BeviMeds | 连接filename_points_covered_by_landmarks类的对象 | ||
| stop_chain | 分块应用MCMC算法直到满足条件 | ||
| subset_variants | 删除没有致病性数据的变体 | ||
| summary.BeviMed | 总结“BeviMed”对象 | ||
| summary.BeviMed_m | 总结filename_points_covered_by_landmarks对象 | ||
| sum_ML_over_PP | 从功率后验输出计算边际似然 | ||
| tune_proposal_sds | MH采样参数的标准差 | ||
| tune_temperatures | 调节温度 |