R语言BatchJobs包说明文档（版本 1.8）

返回R语言所有包列表

BatchJobs-package BatchJobs包
addRegistryPackages 将包添加到注册表。
addRegistrySourceDirs 将源目录添加到注册表。
addRegistrySourceFiles 将源文件添加到注册表。
batchExpandGrid 映射所有组合的函数。
batchExport 导出要在从属服务器上可用的R对象。
BatchJobs BatchJobs包
batchMap 将函数映射到列表或向量上，将作业添加到注册表中。
batchMapQuick makeRegistry、batchMap和submitJobs的组合。
batchMapResults 使用batchMap将函数映射到注册表的结果上。
batchQuery 手动查询BatchJobs数据库
batchReduce 通过向注册表中添加作业的列表上的二进制函数减少。
batchReduceResults 通过二进制函数减少结果，并将此结果的作业添加到注册表中。
batchUnexport 卸载导出的R对象。
callFunctionOnSSHWorkers 对指定的SSH工作进程调用任意函数。
cfBrewTemplate Cluster functions helper：将模板编入作业描述文件。
cfHandleUnknownSubmitError 群集函数帮助程序：在作业提交期间处理未知错误。
cfKillBatchJob Cluster functions helper：通过OS命令终止批处理作业
cfReadBrewTemplate Cluster functions helper：读入brew模板文件。
checkIds 检查作业ID。
ClusterFunctions 创建ClusterFunctions对象。
configuration 批处理作业配置。
debugMulticore 用于调试多核模式的助手函数。
debugSSH 用于调试SSH模式的Helper函数。
filterResults 查找特定条件为真的所有结果。
findDisappeared 根据计算状态查找作业。
findDone 根据计算状态查找作业。
findErrors 根据计算状态查找作业。
findExpired 根据计算状态查找作业。
findJobs 查找与查询匹配的作业的ID。
findMissingResults 根据计算状态查找作业。
findNotDone 根据计算状态查找作业。
findNotErrors 根据计算状态查找作业。
findNotOnSystem 根据计算状态查找作业。
findNotRunning 根据计算状态查找作业。
findNotStarted 根据计算状态查找作业。
findNotSubmitted 根据计算状态查找作业。
findNotTerminated 根据计算状态查找作业。
findOnSystem 根据计算状态查找作业。
findRunning 根据计算状态查找作业。
findStarted 根据计算状态查找作业。
findSubmitted 根据计算状态查找作业。
findTerminated 根据计算状态查找作业。
getConfig 返回BatchJobs配置设置的列表
getErrorMessages 获取作业的错误消息。
getJob 按id从注册表获取作业。
getJobIds 获取注册表中作业的ID。
getJobInfo 获取作业的计算信息。
getJobLocation 获取硬盘上作业文件的物理位置。
getJobNr 获取注册表中的作业数。
getJobParamDf 检索作业参数。
getJobResources 函数获取为某些作业提交的资源。
getJobs 按id从注册表获取作业。
getLogFiles 获取作业的日志文件路径。
getResources 函数获取作业函数中的作业资源。
getSSHWorkersInfo 为SSH工作人员打印并返回R安装和其他信息。
getStatus 检索或显示有关作业的状态信息。
grepLogs 模式的Grep日志文件。
installPackagesOnSSHWorkers 在SSH workers上安装包。
Job 创建职务说明。
killJobs 杀死批处理系统上的一些作业。
loadConfig 加载特定的配置文件。
loadExports 加载导出的R数据对象。
loadRegistry 加载以前保存的注册表。
loadResult 加载特定的结果文件。
loadResults 加载id向量的结果文件。
makeClusterFunctions 创建ClusterFunctions对象。
makeClusterFunctionsInteractive 为在同一会话中顺序执行创建集群函数。
makeClusterFunctionsLocal 为在本地主机上顺序执行创建群集函数。
makeClusterFunctionsLSF 为LSF系统创建集群函数。
makeClusterFunctionsMulticore 在本地Linux机器上使用多个内核生成并行作业。
makeClusterFunctionsOpenLava 为OpenLava系统创建集群函数。
makeClusterFunctionsSGE 为Sun Grid引擎系统创建群集功能。
makeClusterFunctionsSLURM 为基于SLURM的系统创建集群函数。
makeClusterFunctionsSSH 创建一个SSH集群来执行作业。
makeClusterFunctionsTorque 为基于扭矩的系统创建群集函数。
makeJob 创建职务说明。
makeRegistry 构造注册表对象。
makeSSHWorker 为SSH集群函数创建SSH worker。
makeSubmitJobResult 创建SubmitJobResult对象。
reduceResults 减少结果目录中的结果。
reduceResultsDataFrame 减少结果目录中的结果。
reduceResultsDataTable 减少结果目录中的结果。
reduceResultsList 减少结果目录中的结果。
reduceResultsMatrix 减少结果目录中的结果。
reduceResultsVector 减少结果目录中的结果。
Registry 构造注册表对象。
removeRegistry 删除注册表对象。
removeRegistryPackages 从注册表中删除包。
removeRegistrySourceDirs 从注册表中删除包。
removeRegistrySourceFiles 从注册表中删除源文件。
resetJobs 重置作业的计算状态。
sanitizePath 清理路径
setConfig 设置和覆盖配置设置
setJobFunction 为现有作业设置作业函数。
setJobNames 设置作业名称。
setRegistryPackages 为注册表设置包。
showClusterStatus 显示有关群集上可用计算资源的信息。
showLog 显示日志文件的内容。
showStatus 检索或显示有关作业的状态信息。
sourceRegistryFiles 源注册表文件
SSHWorker 为SSH集群函数创建SSH worker。
SubmitJobResult 创建SubmitJobResult对象。
submitJobs 通过集群功能向批处理系统提交作业或作业块。
sweepRegistry 从文件系统中清除过时的文件。
syncRegistry 将暂存查询同步到注册表中。
testJob 通过在新进程中使用Rscript运行作业来测试作业。
waitForJobs 等待批处理系统上的作业终止。
.BatchJobs.R 批处理作业配置。