R语言BarcodingR包说明文档(版本 1.0-3)

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barcodes.eval 条形码评估
barcoding.gap 条形码间距计算
barcoding.spe.identify 利用蛋白质编码条形码进行物种识别
barcoding.spe.identify2 基于模糊集方法和kmer的物种识别
bbsik 基于Kmer的Bp条形码物种识别
char2NumVector 字符到整数向量
compare2delimitations 两种划界的比较
consensus.identify 共识认同
digitize.DNA 数字化德纳宾
DNAbin2kmerFreqMatrix 从DNAbin计算参考序列和查询序列的Kmer频率矩阵
FMF 模糊隶属函数值
FMFtheta12 计算种内和种间变异
NAMES 提取样品标签
optimize.kmer 优化kmer长度
pineMothCOI 松蛾椰子
pineMothITS1 松蛾ITS1
pineMothITS2 松蛾ITS2
sample.ref 参考文献中的样本随机数据集(DNAbin)
save.ids 保存标识
summarize.ref 汇总参考数据
TDR2 TDR2物种成员值
TibetanMoth 藏蛾