R语言BRETIGEA包说明文档(版本 1.0.0)

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BRETIGEA-package BRETIGEA:脑细胞类型特异性基因表达分析
aba_marker_expression 来自Allen Brain Atlas衰老、痴呆和TBI研究子集的标准化FPKM表达数据。
aba_pheno_data Allen brain Atlas衰老、痴呆和TBI研究中大脑样本的表型数据。
adjustBrainCells 估计和调整大量表达数据中的脑细胞类型比例。
adjustCells 调整大量基因表达数据中估计的细胞类型比例。
brainCells 用标记基因估计大量表达数据中的脑细胞类型比例。
BRETIGEA BRETIGEA:脑细胞类型特异性基因表达分析
findCells 使用标记基因从大量基因表达数据中找出细胞类型比例。
markers_df_brain 从人类和小鼠脑细胞基因表达数据的荟萃分析中估计的标记基因。
markers_df_human_brain 仅从人类脑细胞基因表达数据的荟萃分析中估计的标记基因。
markers_df_mouse_brain 仅从小鼠脑细胞基因表达数据的荟萃分析中估计的标记基因。