| bpec | 贝叶斯系统地理和生态聚类（BPEC） | ||
| bpec.contourPlot | 在地理地图上绘制推断聚类的等高线 | ||
| bpec.covariatesPlot | 绘制推断聚类的每个协变量的后边缘分布 | ||
| bpec.geoTree | 系统地理谷歌地图 | ||
| bpec.loadCoords | 装载位置数据 | ||
| bpec.loadSeq | 加载顺序数据 | ||
| bpec.mcmc | BPEC的Markov链montecarlo采样器 | ||
| bpec.treePlot | 指示群集成员身份的树图 | ||
| CladeBrownFrogsCoordsLocs | 褐蛙数据集的坐标和单倍型 | ||
| CladeBrownFrogsRawSeqs | Brown Frog数据集的序列 | ||
| input | 装载位置数据 | ||
| input.bpec | 装载位置数据 | ||
| MacrocnemisCoordsLocs | 巨蛙褐蛙数据集的坐标和单倍型 | ||
| MacrocnemisCoordsLocsMini | 巨蛙褐蛙数据集的坐标和单倍型 | ||
| MacrocnemisRawSeqs | R.macrocnemis Brown Frog数据集的序列 | ||
| mean.bpec | 贝叶斯系统地理和生态聚类（BPEC） | ||
| output.clust | 装载位置数据 | ||
| output.clust.bpec | 装载位置数据 | ||
| output.mcmc | 装载位置数据 | ||
| output.mcmc.bpec | 装载位置数据 | ||
| output.tree | 装载位置数据 | ||
| output.tree.bpec | 装载位置数据 | ||
| plot.bpec | 贝叶斯系统地理和生态聚类（BPEC） | ||
| preproc | 装载位置数据 | ||
| preproc.bpec | 装载位置数据 | ||
| print.bpec | 贝叶斯系统地理和生态聚类（BPEC） | ||
| summary.bpec | 贝叶斯系统地理和生态聚类（BPEC） | ||
| TransalpinaCoordsLocs | burnet蛾数据集的坐标和单倍型。 | ||
| TransalpinaRawSeqs | burnet蛾数据集的序列。 |