A | 氨基酸分析功能 | ||
A.wrapper | 氨基酸包装 | ||
AA.df.check | 列联表检查 | ||
AAtable.builder | 氨基酸列联表构建 | ||
AlignmentFilter | 对齐过滤器 | ||
AlignObj.Create | 路线对象创建者 | ||
AlignObj.Update | 更新的路线对象创建者 | ||
Append.System | 在等位基因串上附加遗传系统基因座名称 | ||
BIGDAWG | BIGDAWG主包装函数 | ||
Build.Matrix | 建立GL2Tab转换的输出矩阵 | ||
buildHAPnames | 单倍型名称生成器 | ||
buildHAPsets | 单倍型列表生成器 | ||
cci | 病例对照优势比计算与作图 | ||
cci.pval | 从Epicalc计算病例对照优势比 | ||
cci.pval.list | 从Epicalc表变异计算病例对照优势比 | ||
Check.Cores | 检查核心参数 | ||
Check.Data | 检查数据结构 | ||
Check.Params | 检查输入参数 | ||
Check.Params.GLS | 检查GLS转换的输入参数 | ||
CheckAlleles | 用于氨基酸分析的HLA等位基因合法性检查 | ||
CheckHLA | 氨基酸分析的HLA格式检查 | ||
CheckLoci | 氨基酸分析的HLA位点合法性检查 | ||
CheckRelease | 用于检查发布版本的函数 | ||
CheckString.Allele | GL字符串等位基因检查 | ||
CheckString.Locus | GL字符串轨迹检查 | ||
Create.Null.Table | 创建空表 | ||
DRB345.Check.Wrapper | DRB345单倍型合子包装 | ||
DRB345.Check.Zygosity | DRB345单倍型合子性检验单位点 | ||
DRB345.Exp | 应为DRB345 | ||
DRB345.parser | DRB345列处理 | ||
Err.Log | 错误代码显示和记录 | ||
EVSremoval | 表达式变量后缀删除 | ||
ExonPtnAlign.Create | 蛋白质外显子比对格式化程序 | ||
ExonPtnList | 外显子2(II类)或2/3(I类)蛋白质比对。 | ||
Filler | 替换或填充00:00等位基因串 | ||
Format.Allele | 不明确的等位基因位点名称格式 | ||
Format.Tab | 表格数据格式工具 | ||
getAllele.Count | 重新计算等位基因数 | ||
getCS.Mat | 卡方矩阵 | ||
getCS.stat | 卡方检验统计量 | ||
GetField | HLA修剪功能 | ||
getFileName | 文件名提取 | ||
GetFiles | 文件获取程序 | ||
getHap | 单倍型制表器 | ||
getObsFreq | 观测频率 | ||
GL2Tab.Loci | GL2Tab的轨迹排序 | ||
GL2Tab.Sub | 类型列表字符串扩展器 | ||
GL2Tab.wrapper | 基因型列表字符串到表格数据的转换 | ||
GLSconvert | 基因型列表字符串转换 | ||
H.MC | 多核单体型分析函数 | ||
H.MC.wrapper | 多核单体型包装器 | ||
HLA_data | HLA数据集示例 | ||
HWE | Hardy-Weinbergy平衡函数 | ||
HWE.ChiSq | Hardy-Weinbergy平衡函数 | ||
HWE.wrapper | Hardy Weinbery包装机 | ||
L | 轨迹分析函数 | ||
L.wrapper | 轨迹包装器 | ||
make2x2 | 使用指定的方向创建2x2表格。 | ||
makeComb | 基因型组合制造者 | ||
MergeData_Output | 数据对象合并和输出 | ||
PgrpExtract | HLA-P群查找器 | ||
PgrpFormat | HLA P组文件格式化程序 | ||
PreCheck | 数据汇总功能 | ||
prepData | 准备导入的数据 | ||
rmABstrings | 替换缺失的等位基因串 | ||
RunChiSq | 卡方列联表检验 | ||
Stripper | 从等位基因中删除系统和基因座 | ||
summaryGeno.2 | 单倍型缺失等位基因汇总函数 | ||
Tab2GL.Loci | Tab2GL的轨迹电容器 | ||
Tab2GL.Sub | 串电容器 | ||
Tab2GL.wrapper | 基因型列表字符串到表格数据的转换 | ||
TableMaker | 制表师 | ||
UpdateRelease | 新IMGT-HLA数据发布后蛋白质比对功能的更新 |