R语言BIEN包说明文档(版本 1.2.4)

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BIEN-package BIEN:访问BIEN数据库的工具。
BIEN BIEN:访问BIEN数据库的工具。
BIEN_list_all 提取BIEN数据库中所有物种的列表。
BIEN_list_country 按国家提取物种列表
BIEN_list_county 按县提取物种列表。
BIEN_list_spatialpolygons 提取给定空间多边形中的物种列表。
BIEN_list_state 按州/省提取物种列表
BIEN_metadata_citation 为从BIEN中提取的数据生成引用。
BIEN_metadata_database_version 下载当前的BIEN数据库版本和发布日期
BIEN_metadata_list_political_names 列出政治分区和相关的地名代码。
BIEN_metadata_match_data 检查新旧数据帧之间的不同记录。
BIEN_occurrence_box 通过纬度/经度边界框提取物种发生记录。
BIEN_occurrence_country 按国家提取物种发生记录。
BIEN_occurrence_county 按县提取物种发生记录。
BIEN_occurrence_family 按族提取物种。
BIEN_occurrence_genus 从BIEN中提取特定属的发生数据
BIEN_occurrence_records_per_species 统计边上每个物种的(地理有效)发生记录数
BIEN_occurrence_spatialpolygons 为指定的SpatialPolygons或SpatialPolygonsDataFrame提取引用数据
BIEN_occurrence_species 从BIEN中提取指定物种的发生数据
BIEN_occurrence_state 按州提取物种发生记录。
BIEN_phylogeny_complete 下载完整的BIEN phylogenies
BIEN_phylogeny_conservative 下载保守的BIEN发展史
BIEN_phylogeny_label_nodes 在系统发育中标记节点
BIEN_plot_country 从指定国家下载绘图数据。
BIEN_plot_dataset 按数据集下载绘图数据。
BIEN_plot_datasource 从给定的数据源下载绘图数据。
BIEN_plot_list_datasource 列出可用的数据源。
BIEN_plot_list_sampling_protocols 列出可用的采样协议。
BIEN_plot_metadata 下载绘图元数据
BIEN_plot_name 按绘图名称下载绘图数据。
BIEN_plot_sampling_protocol 使用指定的采样协议下载绘图数据。
BIEN_plot_spatialpolygons 从指定的spatialPolygons对象下载打印数据。
BIEN_plot_state 从指定的州/省下载绘图数据。
BIEN_ranges_box 下载与指定边界框相交的范围贴图。
BIEN_ranges_genus 下载给定属的范围图。
BIEN_ranges_intersect_species 下载与给定物种范围相交的范围图。
BIEN_ranges_list 列出可用的范围图
BIEN_ranges_load_species 指定物种的负荷范围图。
BIEN_ranges_shapefile_to_skinny 提取范围数据并转换为较小的“精简”格式
BIEN_ranges_skinny_ranges_to_richness_raster 从精简范围文件构建丰富度光栅
BIEN_ranges_spatialpolygons 下载与用户提供的空间多边形对象相交的范围贴图。
BIEN_ranges_species 下载给定物种的范围图。
BIEN_ranges_species_bulk 提取大量物种的范围数据
BIEN_stem_datasource 从BIEN中提取给定数据源的stem数据
BIEN_stem_family 从BIEN中提取指定族的stem数据
BIEN_stem_genus 从BIEN中提取特定属的茎数据
BIEN_stem_sampling_protocol 使用指定的采样协议下载stem数据。
BIEN_stem_species 从BIEN中提取特定物种的茎数据
BIEN_taxonomy_family 为族提取分类信息
BIEN_taxonomy_genus 提取属的分类信息
BIEN_taxonomy_species 提取物种的分类信息
BIEN_trait_country 下载特定国家的特征数据。
BIEN_trait_family 下载给定家庭的特征数据。
BIEN_trait_genus 下载给定属的特征数据。
BIEN_trait_list 列出所有可用的特征数据类型
BIEN_trait_mean 在缺乏物种水平数据的情况下,使用属或科水平数据计算给定性状的物种平均值。
BIEN_trait_species 下载给定物种的特征数据。
BIEN_trait_trait 下载特定特质的所有测量值。
BIEN_trait_traitbyfamily 下载给定家庭和特征的特征数据。
BIEN_trait_traitbygenus 下载给定属/属和性状的性状数据。
BIEN_trait_traitbyspecies 下载给定物种和特征的特征数据。
BIEN_trait_traits_per_species 统计BIEN数据库中每个物种的特征观察数