| BGData-package | 一套用于分析大基因组数据的软件包 | ||
| as.BGData | 将其他对象转换为BGData对象 | ||
| as.BGData.BEDMatrix | 将其他对象转换为BGData对象 | ||
| as.BGData.ColumnLinkedMatrix | 将其他对象转换为BGData对象 | ||
| as.BGData.RowLinkedMatrix | 将其他对象转换为BGData对象 | ||
| BGData | 创建新的BGData实例 | ||
| BGData-class | 表型和基因型数据容器 | ||
| chunkedApply | 对文件支持矩阵的每一行或每一列应用函数 | ||
| chunkedMap | 对文件备份矩阵的每个块应用函数 | ||
| file-backed-matrices | 文件支持的矩阵 | ||
| findRelated | 在关系矩阵中找到相关的个体 | ||
| findRelated.matrix | 在关系矩阵中找到相关的个体 | ||
| findRelated.symDMatrix | 在关系矩阵中找到相关的个体 | ||
| geno | 获取/设置基因型、样本信息和变异信息 | ||
| geno-class | 类矩阵类型的抽象S4类并 | ||
| geno-method | 表型和基因型数据容器 | ||
| geno | 获取/设置基因型、样本信息和变异信息 | ||
| geno | 表型和基因型数据容器 | ||
| getG | 计算基因组关系矩阵 | ||
| getG_symDMatrix | 计算一个非常大的基因组关系矩阵 | ||
| GWAS | 使用BGData对象执行单标记回归 | ||
| load.BGData | 从.RData文件加载BGData（和其他）对象 | ||
| map | 获取/设置基因型、样本信息和变异信息 | ||
| map-method | 表型和基因型数据容器 | ||
| map | 获取/设置基因型、样本信息和变异信息 | ||
| map | 表型和基因型数据容器 | ||
| multi-level-parallelism | 多级并行 | ||
| orderedMerge | 合并两个数据帧，保持第一个数据帧的顺序 | ||
| pheno | 获取/设置基因型、样本信息和变异信息 | ||
| pheno-method | 表型和基因型数据容器 | ||
| pheno | 获取/设置基因型、样本信息和变异信息 | ||
| pheno | 表型和基因型数据容器 | ||
| preprocess | 中心、刻度和插补数据 | ||
| readRAW | 从.raw文件或类似.ped的文件创建BGData对象 | ||
| readRAW_big.matrix | 从.raw文件或类似.ped的文件创建BGData对象 | ||
| readRAW_matrix | 从.raw文件或类似.ped的文件创建BGData对象 | ||
| summarize | 生成各种摘要统计信息 |