R语言BAMBI包说明文档(版本 2.3.0)

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add_burnin_thin 在原始运行后向angmcmc对象添加(额外)burnin和thin
angmcmc 角度MCMC('angmcmc')对象
as.mcmc.list.angmcmc 创建mcmc.列表来自一个mcmc对象的对象
bestcriterion 提取ANGMMC对象的便利函数,以及逐步拟合最佳拟合模型对应的模型选择准则的值
bestmodel 提取ANGMMC对象的便利函数,以及逐步拟合最佳拟合模型对应的模型选择准则的值
bridge_sampler.angmcmc 基于桥抽样的对数边缘似然算法
circ_cor 样本循环相关系数
circ_varcor_model 二元角模型的解析圆方差和相关
contour.angmcmc 基于二元数据的mcmc对象等高线图
contour_model 二元角混合模型密度的等值线图
densityplot.angmcmc MCMC对象的密度图
DIC ANGMMC对象的偏差信息准则(DIC)
dvm 一元von Mises分布
dvmcos 二元von Mises余弦模型
dvmcosmix 二元von Mises余弦混合模型
dvmmix 一元von-Mises混合物
dvmsin 二元von Mises正弦模型
dvmsinmix 二元von Mises-sine混合模型
dwnorm 一元包裹正态分布
dwnorm2 二元包裹正态分布
dwnorm2mix 二元包裹正态混合物
dwnormmix 一元包裹正态混合物
d_fitted 密度和随机偏离ANGMMC对象
extractsamples 从MCMC对象中提取参数的MCMC样本
fit_angmix 二元和一元角混合模型的拟合
fit_incremental_angmix 构件尺寸递增的角混合模型逐步拟合及模型优选
fit_vmcosmix 用MCMC拟合二元von-Mises-cosine混合模型
fit_vmmix 用MCMC拟合单变量von-Mises混合物
fit_vmsinmix 用MCMC拟合二元von-Mises-sine混合模型
fit_wnorm2mix 基于MCMC的二元包裹正态混合模型拟合
fit_wnormmix 用MCMC拟合单变量包裹正态混合物
fix_label 修复MCMC对象中的标签切换
is.angmcmc 角度MCMC('angmcmc')对象
latent_allocation 从angmcmc对象查找潜在分配(组件指示符)
logLik.angmcmc 从mcmc对象中提取对数似然
loo.angmcmc 对于angmcmc对象,去掉一个交叉验证(LOO)
lpdtrace ANGMMC物体对数后验密度或对数似然的迹和自相关图
minuspi_to_pi 将角度包装成“$-pi,pi¥”或“$0,2*pi¥”
paramtrace angmcmc对象参数的跟踪图
plot.angmcmc MCMC对象的摘要图
pointest ANGMMC对象参数的点估计
quantile.angmcmc angmcmc对象参数的分位数估计
rvm 一元von Mises分布
rvmcos 二元von Mises余弦模型
rvmcosmix 二元von Mises余弦混合模型
rvmmix 一元von-Mises混合物
rvmsin 二元von Mises正弦模型
rvmsinmix 二元von Mises-sine混合模型
rwnorm 一元包裹正态分布
rwnorm2 二元包裹正态分布
rwnorm2mix 二元包裹正态混合物
rwnormmix 一元包裹正态混合物
r_fitted 密度和随机偏离ANGMMC对象
select_chains 从MCMC对象中选择链
summary.angmcmc 来自ANGMMC对象的参数的摘要统计信息
surface_model 二元角混合模型密度的曲面
tim8 磷酸丙糖异构酶的主链二面角(8TIM)
vm2_mle 二元von-Mises参数的极大似然估计
waic.angmcmc angmcmc对象的Watanabe-Akaike信息准则(WAIC)
wind 土星岛风向
zero_to_2pi 将角度包装成“$-pi,pi¥”或“$0,2*pi¥”