R语言AnalyzeFMRI包说明文档（版本 1.1-21）

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analyze2nifti 从分析文件创建NIFTI文件
centering 对中
cluster.threshold 数组的群集阈值。
cluster_mass 数组的群集阈值。
cov.est 估计相邻体素之间的协方差
covariance_est 估计相邻体素之间的协方差
diminfo2fps 小信息2fps
EC.3D 三维随机场的期望欧拉特征
eigenvalues 特征值
f.analyze.file.summary 打印.img文件内容摘要
f.analyzeFMRI.gui 启动分析功能磁共振图形用户界面
f.basic.hdr.list.create 以ANALYZE格式创建basic.hdr列表
f.basic.hdr.nifti.list.create 以NIFTI格式创建basic.hdr列表
f.complete.hdr.nifti.list.create 以NIFTI格式创建完整的.hdr列表
f.ica.fmri 将空间ICA（独立分量分析）应用于fMRI数据集
f.ica.fmri.gui tcltkgui将ICA应用于fMRI数据集
f.icast.fmri 将空间或时间ICA（独立分量分析）应用于fMRI-NIFTI数据集
f.icast.fmri.gui tcltkgui将空间或时间ICA应用于fMRI-NIFTI数据集
f.nifti.file.summary 打印.img文件内容摘要
f.plot.ica.fmri 从f的输出绘制指定的组件。功能磁共振成像
f.plot.ica.fmri.jpg 绘制f的输出分量。功能磁共振成像到一系列jpeg文件
f.plot.volume.gui tcltk图形用户界面显示功能磁共振成像或磁共振成像图像
f.read.analyze.header 读取分析头文件
f.read.analyze.slice 从.img文件中读取一个切片
f.read.analyze.slice.at.all.timepoints 从.img文件的所有时间点读取切片
f.read.analyze.tpt 在一个时间点读入一卷
f.read.analyze.ts 读入一个体素时间序列
f.read.analyze.volume 读取整个.img文件
f.read.header 读取或分析NIFTI头文件
f.read.nifti.header 读取Nifti头文件
f.read.nifti.slice 以NIFTI格式从.img或.nii文件中读取一个切片
f.read.nifti.slice.at.all.timepoints 从NIFTI.img或.nii文件的所有时间点读取切片
f.read.nifti.tpt 在一个时间点读入一卷
f.read.nifti.ts 读入一个体素时间序列
f.read.nifti.volume 读取整个图像文件
f.read.volume 读取整个图像文件
f.spectral.summary 绘制fMRI数据集光谱特性的图形摘要
f.spectral.summary.nifti 绘制fMRI数据集光谱特性的图形摘要
f.write.analyze 以ANALYZE格式将数组写入.img/.hdr对
f.write.array.to.img.2bytes 写入2字节整数数组
f.write.array.to.img.8bit 写入1字节整数数组
f.write.array.to.img.float 写入4字节浮点数组
f.write.list.to.hdr 以ANALYZE格式写入.hdr文件
f.write.list.to.hdr.nifti 以NITI格式写入.hdr文件
f.write.nifti 将数组写入NIFTI格式的.img/.hdr对或.nii文件
f.write.nii.array.to.img.2bytes 写入2字节整数数组，并在文件开头添加NIFTI头部分
f.write.nii.array.to.img.8bit 写入1字节整数数组，并在文件开头添加NIFTI头部分
f.write.nii.array.to.img.float 写入4字节浮点数组，并在文件开头添加NIFTI头部分
fourDto2D 四至二维
fps2diminfo fps2diminfo文件
gaussfilter1 计算离散高斯平滑核。
gaussfilter2 计算离散高斯平滑核。
GaussSmoothArray 具有高斯核的空间光滑阵列。
GaussSmoothKernel 计算离散高斯平滑核。
ICAspat 伊卡斯帕
ICAtemp 伊卡坦普
ica_fmri_JM 伊卡斯帕
ijk2xyz ijk2xyz公司
magicfield 从图像文件的头部获取magicfield
mat34.to.TRSZ 仿射4x4（或3x4）矩阵以平移、旋转、剪切和缩放
mat34.to.TZSR 仿射4x4（或3x4）矩阵以平移、缩放、剪切和旋转
model.2.cov.func 从Hartvig模型2计算协方差
model.2.est.gamma Hartvig和Jensen（2000）模型2的伽马估计
N2G 适合N2G型号
N2G.Class.Probability N2G模型的后验概率
N2G.Density 计算N2G模型的密度函数
N2G.Fit N2G模型的优化函数
N2G.Inverse 将N2G模型的参数变换回它们的实域
N2G.Likelihood 计算N2G模型的（负）可能性
N2G.Likelihood.Ratio N2G似然比
N2G.Region N2G正态分量间隔
N2G.Spatial.Mixture fMRI空间混合建模
N2G.Transform 变换N2G模型的参数，使其位于实线上。
nifti.quatern.to.mat44 四元数（等…）到仿射4x4矩阵
NonLinearSmoothArray 三维和四维阵列的非线性空间定位。
non_lin_gauss_smooth 三维和四维阵列的非线性空间定位。
orientation 定向存储器
Q2R 四元数到旋转
R2Q 旋转到四元数
read2byte_v1_JM 读取整个.img文件
read4byte_v1_JM 读取整个.img文件
readchar_v1_JM 读取整个.img文件
readdouble_v1_JM 读取整个.img文件
readfloat_v1_JM 读取整个.img文件
read_analyze_header_wrap_JM 读取整个.img文件
read_nifti_header_wrap_JM 读取Nifti头文件
read_nifti_magic_wrap 读取Nifti头文件
reduction 减少
Sim.3D.GammaRF 模拟伽马分布随机场
Sim.3D.GRF 模拟GRF
sim_grf 模拟GRF
SmoothEst 高斯随机场方差协方差矩阵的估计
spatial_mixture fMRI空间混合建模
st2xyzt st2xyzt公司
swaptest_wrap_JM 读取整个.img文件
temporal_non_lin_gauss_smooth 三维和四维阵列的非线性空间定位。
threeDto4D 三维到四维
Threshold.Bonferroni 计算Bonferroni阈值
Threshold.FDR 错误发现率（FDR）阈值
Threshold.RF 随机场理论。
twoDto4D 2到4D
write2byteappend_JM 以ANALYZE格式将数组写入.img/.hdr对
write2byte_JM 读取整个.img文件
write8bitappend_JM 以ANALYZE格式将数组写入.img/.hdr对
write8bit_JM 以ANALYZE格式将数组写入.img/.hdr对
writefloatappend_JM 以ANALYZE格式将数组写入.img/.hdr对
writefloat_JM 以ANALYZE格式将数组写入.img/.hdr对
write_analyze_header_wrap_JM 以ANALYZE格式将数组写入.img/.hdr对
write_nifti_header_wrap_JM 以ANALYZE格式将数组写入.img/.hdr对
xyz2ijk xyz2ijk公司
xyzt2st xyzt2st型