R语言ActiveDriverWGS包说明文档(版本 1.1.1)

返回R语言所有包列表

.fix_all_results ighd_hum_df验证结果表的格式和p值是否正确
.get_3n_context_of_mutations 这个功能发现了突变的三核苷酸背景
.get_obs_exp 计算基于
.get_signf_results 返回重要结果
.make_mut_signatures 产生变异信号
.split_coord_fragments_in_BED 将BED12文件拆分为单独的区域
ActiveDriverWGS ActiveDriverWGS是一种用于癌症全基因组中简单体细胞突变的驱动程序发现工具
ADWGS_test ighd_hum_df执行ActiveDriverWGS的统计测试
cancer_genes ighd_hum_df
cancer_gene_sites 癌症基因中的翻译后修饰位点
cll_mutations CLL突变
format_muts 此函数过滤超突变样本并返回带有适当三核苷酸上下文的格式化突变
prepare_elements_from_BED12 从BED12文件准备元素坐标
prepare_elements_from_BED4 从BED4文件准备元素坐标