| clonalExpansion | 克隆地扩展由fullRepertoire函数生成的模拟曲目。 | ||
| fullRepertoire | 模拟人或小鼠的全重链抗体库。 | ||
| hotspot_df | ighd_hum_df | ||
| ighd_hum_df | ighd_hum_df | ||
| ighd_mus_df | ighd_hum_df | ||
| ighj_hum_df | ighd_hum_df | ||
| ighj_mus_df | ighd_hum_df | ||
| ighv_hum_df | ighd_hum_df | ||
| ighv_mus_df | ighd_hum_df | ||
| igkj_hum_df | ighd_hum_df | ||
| igkj_mus_df | ighd_hum_df | ||
| igkv_hum_df | ighd_hum_df | ||
| igkv_mus_df | ighd_hum_df | ||
| iglj_hum_df | ighd_hum_df | ||
| iglj_mus_df | ighd_hum_df | ||
| iglv_hum_df | ighd_hum_df | ||
| iglv_mus_df | ighd_hum_df | ||
| one_spot_df | ighd_hum_df | ||
| repertoireFastas | 将AbSim的输出序列和名称转换为fasta文件格式。在reperture中的每一棵树都将存储在一个单独的fasta文件中。利用R基的sink（）和cloneAllConnections（） | ||
| singleLineage | 仅使用一组V（D）J种系基因的抗体谱系模拟。此函数与fullRepertoire函数的主要区别在于，在一棵树中可以有多个VDJ重组事件。singleLineage函数中的每个VDJ重组事件都是现有树中的分支事件，而fullRepertoire函数中的VDJ重组事件启动一个新树。 |